LET THERE BE LIGHT (BUT NOT TOO MUCH): MOLECULAR EVOLUTION OF LIGHT‐HARVESTING COMPLEXES
Notice bibliographique
Résumé
The light‐harvesting antennas common to all photosynthetic eukaryotes belong to two protein familes: the Chl a‐binding core complex family (e.g. CP47, CP43), and the LHC superfamily, whose members bind a variety of Chls. The former are all chloroplast‐encoded and have high sequence similarity to their cyanobacterial homologs; the latter are all nucleus‐encoded and have a much more complex relationship with each other and their (presumed) cyanobacterial ancestors. Phylogenetic analysis of the LHC superfamily protein sequences show that they follow the endosymbiotic history of their hosts and suggest that the ancestral cyanobacterial genes were copied to the nucleus soon after the establishment of the primary endosymbiosis. Both families have members whose role appears to be related to photoprotection rather than light‐harvesting, suggesting that these families may have originated as stress‐response proteins. In support of this, all members of the LHC superfamily bind significant amounts of carotenoid, and much of the variation between them resides in the bewildering array of different carotenoids they bind. In fact, it has been suggested that this family originated as carotenoid‐binding proteins and only later acquired Chl (Gantt, E. 1998; Photosynthesis: Mechanisms & Effects I, pp. 239‐246).
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,002 | 0,003 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».