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Enregistrement W2123369892 · doi:10.1093/neuonc/nor195

Maintenance of primary tumor phenotype and genotype in glioblastoma stem cells

2011· article· en· W2123369892 sur OpenAlexaff
Hiroaki Wakimoto, Gayatry Mohapatra, Ryuichi Kanai, William T. Curry, Stephen Yip, Masae Nitta, Anoop P. Patel, Zachary R. Barnard, Anat Stemmer‐Rachamimov, David N. Louis, R L Martuza, Samuel D. Rabkin

Notice bibliographique

RevueNeuro-Oncology · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGlioma Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensBC Cancer Agency
Organismes subventionnairesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNational Cancer InstituteU.S. Department of Defense
Mots-clésBiologyComparative genomic hybridizationStem cellPhenotypeCancer researchFluorescence in situ hybridizationPathologyNeurosphereGeneGeneticsMedicineChromosomeCellular differentiation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The clinicopathological heterogeneity of glioblastoma (GBM) and the various genetic and phenotypic subtypes in GBM stem cells (GSCs) are well described. However, the relationship between GSCs and the corresponding primary tumor from which they were isolated is poorly understood. We have established GSC-enriched neurosphere cultures from 15 newly diagnosed GBM specimens and examined the relationship between the histopathological and genomic features of GSC-derived orthotopic xenografts and those of the respective patient tumors. GSC-initiated xenografts recapitulate the distinctive cytological hallmarks and diverse histological variants associated with the corresponding patient GBM, including giant cell and gemistocytic GBM, and primitive neuroectodermal tumor (PNET)-like components. This indicates that GSCs generate tumors that preserve patient-specific disease phenotypes. The majority of GSC-derived intracerebral xenografts (11 of 15) demonstrated a highly invasive behavior crossing the midline, whereas the remainder formed discrete nodular and vascular masses. In some cases, GSC invasiveness correlated with preoperative MRI, but not with the status of PI3-kinase/Akt pathways or O(6)-methylguanine methyltransferase expression. Genome-wide screening by array comparative genomic hybridization and fluorescence in situ hybridization revealed that GSCs harbor unique genetic copy number aberrations. GSCs acquiring amplifications of the myc family genes represent only a minority of tumor cells within the original patient tumors. Thus, GSCs are a genetically distinct subpopulation of neoplastic cells within a GBM. These studies highlight the value of GSCs for preclinical modeling of clinically relevant, patient-specific GBM and, thus, pave the way for testing novel anti-GSC/GBM agents for personalized therapy.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,248
Écart entre enseignants0,225 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations239
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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