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Enregistrement W2123380826 · doi:10.25011/cim.v33i6.14584

Discovery research to clinical trial: A ten year journey

2010· article· en· W2123380826 sur OpenAlexafffundvenue
Torsten O. Nielsen

Notice bibliographique

RevueClinical and investigative medicine · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCAR-T cell therapy research
Établissements canadiensVancouver Hospital and Health Sciences CentreUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesMichael Smith Health Research BCCanadian Institutes of Health ResearchTerry Fox FoundationCancer Research Society
Mots-clésMedicineClinical trialInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Clinician-scientists have the training and motivation to translate basic science into tools for improved clinical care, but the road to achieve this is hardly straight forward, particularly for large scale genomic datasets. This year's Joe Doupe Young Investigator award winner, Dr. Torsten Nielsen, details successful examples of new scientific insights, diagnostics and clinical trials that have resulted from microarray-based gene expression profiling of sarcomas: TLE1 as a biomarker for synovial sarcoma, histone deacetylase inhibitor therapy for translocation-associated sarcomas of young adults, and CSF1 pathway inhibitors for tenosynovial giant cell tumors. Results from exciting, emerging next generation sequencing technologies will need to undergo similar validation and preclinical studies before they can be expected to impact patient care.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,231
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,196
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,231
Score d'incertitude au seuil0,948

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,2310,196
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0040,003
Méta-épidémiologie (sens large)0,0090,005
Bibliométrie0,0070,006
Études des sciences et des technologies0,0060,018
Communication savante0,0320,030
Science ouverte0,0080,016
Intégrité de la recherche0,0310,036
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0400,016

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,567
Tête enseignante GPT0,554
Écart entre enseignants0,013 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2010
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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