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Enregistrement W2123381470 · doi:10.1093/infdis/jir304

Identifying the Early Post-HIV Antibody Seroconversion Period

2011· article· en· W2123381470 sur OpenAlexaff
Frederick Hecht, Robert Wellman, Michael P. Busch, Christopher D. Pilcher, Philip J. Norris, Joseph B. Margolick, Ann C. Collier, Susan J. Little, Martin Markowitz, Jean‐Pierre Routy, Sarah Holte

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Infectious Diseases · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueHIV Research and Treatment
Établissements canadiensMcGill UniversityMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesNational Center for Research ResourcesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesBlood Systems Research Institute
Mots-clésSeroconversionHuman immunodeficiency virus (HIV)MedicineVirologyAntibodyImmunologyViral disease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Identifying persons with recent human immunodeficiency virus (HIV) antibody seroconversion is useful for treatment, research, and prevention, but the sensitivity and specificity of tests for this purpose are uncertain. METHODS: We used longitudinal specimens panels from 155 persons identified prior to HIV seroconversion to assess antibody-based methods for classifying persons as within 30, 60, or 90 days of seroconversion, including 2 incidence assays, a less-sensitive (LS) enzyme immunoassay (EIA), and the BED assay. RESULTS: Sensitivity and specificity, respectively, for identifying persons within 30 days of seroconversion were: 34%-57% and 98%-100% for 2 standard EIAs (employing a signal-to-cutoff ≤4.0; ≥1.0 defines HIV positive), 84% and 73% for the LS-EIA (≤0.2 cutoff), 88% and 72% for the BED (≤0.2 cutoff), and 43%-58% and 98% (≤3 bands) for 2 Western blot (WB) assays. By area under the receiver operator curves, the best test for identifying persons within 30 days of seroconversion was the number of bands on the Bio-Rad WB (0.90); within 60 days, the LS-EIA and BED (both 0.85); and for persons within 90 days the BED (0.86). CONCLUSIONS: Standard EIAs, Western blots, and HIV incidence assays provide useful information for identifying persons 30 to 90 days after seroconversion.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,267
Écart entre enseignants0,251 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations20
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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