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Enregistrement W2123410777 · doi:10.1139/z05-025

Comment on "Identifying spiders through DNA barcodes"

2005· article· en· W2123410777 sur OpenAlexvenueno aff
Lorenzo Prendini

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Zoology · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueSpider Taxonomy and Behavior Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDNA barcodingBiologyIdentification (biology)Evolutionary biologyMitochondrial DNASpiderTaxonomy (biology)CladeComputational biologyDNAZoologyPhylogeneticsEcologyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

R.D.H. Barrett and P.D.N Hebert have demonstrated that it is possible to identify members of a mostly local spider fauna using a short fragment of the mitochondrial gene coding for cytochrome c oxidase I. There are instances where DNA-based identification may be very useful, e.g., in identifying juvenile life stages of groups in which adults are required for morphological identification, or matching morphologically different sexes or life stages when those associations are unknown. DNA-based identification may be the easiest and most cost-effective way, or even the only feasible way, to address some of these questions. However, these are also the least challenging problems in taxonomy, and their solution is unlikely to relieve the "taxonomic impediment". Furthermore, to promote the utility of DNA barcoding as a global identification system, these authors must demonstrate that their approach works for distinguishing all the members of a speciose clade, wherever in the world they occur. Much of diversity occurs allopatrically and neither the study by R.D.H. Barrett and P.D.N. Hebert, nor any other presented to date, even begins to address the feasibility of DNA-based identification at this level of detail.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,005
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,028
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Commentaire · Signal consensuel: Commentaire
Score de désaccord entre enseignants0,047
Score d'incertitude au seuil0,068

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0050,028
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,002
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0040,005
Communication savante0,0020,005
Science ouverte0,0050,002
Intégrité de la recherche0,0470,039
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,009

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,039
Tête enseignante GPT0,278
Écart entre enseignants0,238 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreCommentaire

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations127
Publié2005
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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