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Enregistrement W2123415640 · doi:10.1074/jbc.m010508200

Calexcitin B Is a New Member of the Sarcoplasmic Calcium-binding Protein Family

2001· article· en· W2123415640 sur OpenAlexafffund
Zoltán Gombos, Andreas Jeromin, Tapas K. Mal, Avijit Chakrabartty, Mitsuhiko Ikura

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNeurobiology and Insect Physiology Research
Établissements canadiensLunenfeld-Tanenbaum Research InstituteMount Sinai HospitalUniversity of TorontoOntario Institute for Cancer Research
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteCanadian Institutes of Health ResearchSavoy FoundationAmgen
Mots-clésEF handRyanodine receptorCalcium-binding proteinBiologyBiochemistryGene productGTP'Peptide sequenceG proteinBinding proteinEndoplasmic reticulumCalciumGeneMolecular biologyChemistryReceptorGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Calexcitin (CE) is a calcium sensor protein that has been implicated in associative learning. The CE gene was previously cloned from the long-finned squid, Loligo pealei, and the gene product was shown to bind GTP and modulate K(+) channels and ryanodine receptors in a Ca(2+)-dependent manner. We cloned a new gene from L. pealei, which encodes a CE-like protein, here named calexcitin B (CE(B)). CE(B) has 95% amino acid identity to the original form. Our sequence analyses indicate that CEs are homologous to the sarcoplasmic calcium-binding protein subfamily of the EF-hand superfamily. Far and near UV circular dichroism and nuclear magnetic resonance studies demonstrate that CE(B) binds Ca(2+) and undergoes a conformational change. CE(B) is phosphorylated by protein kinase C, but not by casein kinase II. CE(B) does not bind GTP. Western blot experiments using polyclonal antibodies generated against CE(B) showed that CE(B) is expressed in the L. pealei optic lobe. Taken together, the neuronal protein CE represents the first example of a Ca(2+) sensor in the sarcoplasmic calcium-binding protein family.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,103
Tête enseignante GPT0,324
Écart entre enseignants0,221 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2001
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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