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Enregistrement W2123420986 · doi:10.1074/jbc.m802569200

Negative Regulation of the Yeast ABC Transporter Ycf1p by Phosphorylation within Its N-terminal Extension

2008· article· en· W2123420986 sur OpenAlexafffund
Christian M. Paumi, Matthew Chuk, Igor Chevelev, Igor Štagljar, Susan Michaelis

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueDrug Transport and Resistance Mechanisms
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesGenentechNational Cancer InstituteNational Institutes of HealthGenome CanadaOntario GenomicsNational Institute of General Medical SciencesOntario Genomics Institute
Mots-clésTerminal (telecommunication)YeastPhosphorylationExtension (predicate logic)TransporterATP-binding cassette transporterCell biologyChemistryBiochemistryBiologyGeneticsGeneComputer scienceComputer network

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The yeast vacuolar membrane protein Ycf1p and its mammalian counterpart, MRP1, belong to the ABCC subfamily of ATP-binding cassette (ABC) transporters that rid cells of toxic endogenous and xenobiotic compounds. Like most members of the ABCC subfamily, Ycf1p contains an N-terminal extension in addition to its ABC "core" domain and transports substrates in the form of glutathione conjugates. Ycf1p is subject to complex regulation to ensure its optimal function. Previous studies showed that Ycf1p activity is stimulated by a guanine nucleotide exchange factor, Tus1p, and is positively regulated by phosphorylation in its ABC core domain at residues Ser-908 and Thr-911. Here we provide evidence that phosphorylation of Ser-251 in the Ycf1p N-terminal extension negatively regulates activity. Mutant Ycf1p-S251A exhibits increased resistance to cadmium in vivo and increased Ycf1p-dependent transport of [(3)H]estradiol-beta-17-glucuronide in vitro as compared with wild-type Ycf1p. Activity is restored to the wild-type level for Ycf1-S251E. To identify kinase(s) that negatively regulate Ycf1p function, we conducted an integrated membrane yeast two-hybrid (iMYTH) screen and identified two kinase genes, CKA1 and HAL5, deletion of which increases Ycf1p function. Genetic evidence suggests that Cka1p may regulate Ycf1p function through phosphorylation of Ser-251 either directly or indirectly. Overall, this study provides compelling evidence that negative, as well as positive, regulation of Ycf1p is mediated by phosphorylation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,236
Écart entre enseignants0,213 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations55
Publié2008
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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