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Enregistrement W2123427619 · doi:10.1161/strokeaha.114.006096

Genome-Wide Association Study of Intracranial Aneurysm Identifies a New Association on Chromosome 7

2014· review· en· W2123427619 sur OpenAlexaff
Tatiana Foroud, Dongbing Lai, Daniel L. Koller, Femke van’t Hof, Mitja Kurki, Craig S. Anderson, Robert D. Brown, E. Sander Connolly, Johan G. Eriksson, Matthew L. Flaherty, Myriam Fornage, Mikael von und zu Fraunberg, Emília Ilona Gaál, Aki Laakso, Juha Hernesniemi, John Huston, Juha E. Jääskeläinen, Lambertus A. Kiemeney, Riku Kivisaari, Dawn Kleindorfer, Nerissa Ko, Hanna Lehto, Jason Mackey, Irene Meissner, Charles J. Moomaw, Thomas H. Mosley, Marek Moskała, Mika Niemelä, Aarno Palotie, Joanna Pera, Gabriël J.E. Rinkel, Stephan Ripke, Guy A. Rouleau, Ynte M. Ruigrok, Laura Sauerbeck, Agnieszka Słowik, Sita H. Vermeulen, Daniel Woo, Bradford B. Worrall, Joseph P. Broderick

Notice bibliographique

RevueStroke · 2014
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueIntracranial Aneurysms: Treatment and Complications
Établissements canadiensUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesNational Center for Advancing Translational SciencesNational Center for Research ResourcesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNational Human Genome Research InstituteNational Heart, Lung, and Blood InstituteU.S. Public Health Service
Mots-clésMedicineAneurysmGenome-wide association studyAssociation (psychology)ChromosomeGenetic associationGenomeGeneticsPathologyGeneRadiologySingle-nucleotide polymorphismGenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND AND PURPOSE: Common variants have been identified using genome-wide association studies which contribute to intracranial aneurysms (IA) susceptibility. However, it is clear that the variants identified to date do not account for the estimated genetic contribution to disease risk. METHODS: Initial analysis was performed in a discovery sample of 2617 IA cases and 2548 controls of white ancestry. Novel chromosomal regions meeting genome-wide significance were further tested for association in 2 independent replication samples: Dutch (717 cases; 3004 controls) and Finnish (799 cases; 2317 controls). A meta-analysis was performed to combine the results from the 3 studies for key chromosomal regions of interest. RESULTS: Genome-wide evidence of association was detected in the discovery sample on chromosome 9 (CDKN2BAS; rs10733376: P<1.0×10(-11)), in a gene previously associated with IA. A novel region on chromosome 7, near HDAC9, was associated with IA (rs10230207; P=4.14×10(-8)). This association replicated in the Dutch sample (P=0.01) but failed to show association in the Finnish sample (P=0.25). Meta-analysis results of the 3 cohorts reached statistical significant (P=9.91×10(-10)). CONCLUSIONS: We detected a novel region associated with IA susceptibility that was replicated in an independent Dutch sample. This region on chromosome 7 has been previously associated with ischemic stroke and the large vessel stroke occlusive subtype (including HDAC9), suggesting a possible genetic link between this stroke subtype and IA.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,927
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,302
Écart entre enseignants0,276 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations69
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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