MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2123446926 · doi:10.1371/journal.pgen.1002158

Identification of a Sudden Cardiac Death Susceptibility Locus at 2q24.2 through Genome-Wide Association in European Ancestry Individuals

2011· article· en· W2123446926 sur OpenAlexafffund
Dan E. Arking, Juhani Junttila, Philippe Goyette, Adriana Huertas‐Vázquez, Mark Eijgelsheim, Marieke T. Blom, Christopher Newton‐Cheh, Kyndaron Reinier, Carmen Teodorescu, Audrey Uy‐Evanado, Naima Carter‐Monroe, Kari Kaikkonen, Marja‐Leena Kortelainen, Gabrielle Boucher, Caroline Lagacé, Anna Moes, Xiaoqing Zhao, Frank D. Kolodgie, Fernando Rivadeneira, Albert Hofman, Jacqueline C.M. Witteman, André G. Uitterlinden, Roos F. Marsman, Raha Pazoki, Abdennasser Bardai, Rudolph W. Koster, Abbas Dehghan, Shih‐Jen Hwang, Pallav Bhatnagar, Wendy S. Post, Gina M. Hilton, Ronald J. Prineas, Man Li, Anna Köttgen, Georg Ehret, Eric Boerwinkle, Josef Coresh, W.H. Linda Kao, Bruce M. Psaty, Gordon F. Tomaselli, Nona Sotoodehnia, David S. Siscovick, Greg Burke, Eduardo Marbán, Peter M. Spooner, L. Adrienne Cupples, Jonathan Jui, Karen Gunson, Y. Antero Kesäniemi, Arthur A.M. Wilde, Jean‐Claude Tardif, Christopher J. O’Donnell, Connie R. Bezzina, Renu Virmani, Bruno H. Stricker, Hanno L. Tan, Christine M. Albert, Aravinda Chakravarti, John D. Rioux, Heikki V. Huikuri, Sumeet S. Chugh

Notice bibliographique

RevuePLoS Genetics · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic Associations and Epidemiology
Établissements canadiensUniversité de MontréalMontreal Heart Institute
Organismes subventionnairesNational Center for Research ResourcesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNational Cancer InstituteNational Heart, Lung, and Blood InstituteU.S. Public Health ServiceNational Human Genome Research InstituteNederlandse Organisatie voor Wetenschappelijk OnderzoekNational Institutes of HealthFondation Institut de Cardiologie de MontréalCollege ter Beoordeling van GeneesmiddelenInstitut de Cardiologie de MontréalFondation LeducqEuropean CommissionZonMwSchool of Medicine, Boston UniversityErasmus Medisch CentrumBurroughs Wellcome Fund
Mots-clésGenome-wide association studyBiologyLocus (genetics)GenotypingSudden cardiac deathSingle-nucleotide polymorphismAlleleGeneticsGenetic associationQT intervalQRS complexEpidemiologyGenotypeInternal medicineMedicineGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Sudden cardiac death (SCD) continues to be one of the leading causes of mortality worldwide, with an annual incidence estimated at 250,000-300,000 in the United States and with the vast majority occurring in the setting of coronary disease. We performed a genome-wide association meta-analysis in 1,283 SCD cases and >20,000 control individuals of European ancestry from 5 studies, with follow-up genotyping in up to 3,119 SCD cases and 11,146 controls from 11 European ancestry studies, and identify the BAZ2B locus as associated with SCD (P = 1.8×10(-10)). The risk allele, while ancestral, has a frequency of ~1.4%, suggesting strong negative selection and increases risk for SCD by 1.92-fold per allele (95% CI 1.57-2.34). We also tested the role of 49 SNPs previously implicated in modulating electrocardiographic traits (QRS, QT, and RR intervals). Consistent with epidemiological studies showing increased risk of SCD with prolonged QRS/QT intervals, the interval-prolonging alleles are in aggregate associated with increased risk for SCD (P = 0.006).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,005
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,015

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,005
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,002
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,047
Tête enseignante GPT0,270
Écart entre enseignants0,223 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations165
Publié2011
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuePLoS GeneticsMême sujetGenetic Associations and EpidemiologyTravaux en français237 207