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Enregistrement W2123466564 · doi:10.1101/cshperspect.a004069

Organellar Calcium Buffers

2011· review· en· W2123466564 sur OpenAlexafffund
Daniel Prins, Marek Michalak

Notice bibliographique

RevueCold Spring Harbor Perspectives in Biology · 2011
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCellular transport and secretion
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchAlberta Innovates
Mots-clésOrganelleEndoplasmic reticulumBiologyIntracellularCell biologyCalcium signalingCalciumSecond messenger systemChemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Ca 2þ is an important intracellular messenger affecting many diverse processes.In eukaryotic cells, Ca 2þ storage is achieved within specific intracellular organelles, especially the endoplasmic/sarcoplasmic reticulum, in which Ca 2þ is buffered by specific proteins known as Ca 2þ buffers.Ca 2þ buffers are a diverse group of proteins, varying in their affinities and capacities for Ca 2þ , but they typically also carry out other functions within the cell.The wide range of organelles containing Ca 2þ and the evidence supporting cross-talk between these organelles suggest the existence of a dynamic network of organellar Ca 2þ signaling, mediated by a variety of organellar Ca 2þ buffers. INTRACELLULAR Ca 2þ DYNAMICSC a 2þ serves as an intracellular messenger in various cellular processes, including muscle contraction, gene expression, and fertilization (Berridge et al. 2003).To use Ca 2þ , the cell requires a readily mobilizable source of Ca 2þ , the majority of which is found within the lumen of the endoplasmic reticulum (ER) and/or sarcoplasmic reticulum (SR), but is also located in the Golgi apparatus, peroxisomes, mitochondria, and endolysosomal compartments.It is not surprising that Ca 2þ levels are of central importance in dictating the function of proteins that reside in intracellular organelles.Although some Ca 2þ exists as free ions within these compartments, much of it is buffered by specific proteins, simply known as Ca 2þ buffers.However, these proteins are diverse in terms of structure, oligomerization, affinity and capacity for Ca 2þ , and physical basis for binding Ca 2þ ions, one commonality across Ca 2þ buffers is that they also serve other roles within the cell.These roles include catalyzing the correct folding of other cellular proteins, regulating Ca 2þ release and retention, and communicating information about Ca 2þ levels within organelles to other proteins. ENDOPLASMIC RETICULUMThe ER is a multifunctional organelle within the eukaryotic cell that serves as the single largest Ca 2þ store inside nonstriated muscle cells.The ER is also responsible for functions as diverse as protein synthesis and posttranslational modification, lipid and steroid metabolism, and drug detoxification (Michalak and Opas 2009).Within the ER lumen, the total concentration of Ca 2þ is approximately 1 mM, with free Ca 2þ in the range of approximately 200 mM and the remainder buffered via ER resident proteins (Michalak and Opas 2009).Most ER Ca 2þ

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,013

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,000
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0020,003
Science ouverte0,0020,002
Intégrité de la recherche0,0020,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,009

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,038
Tête enseignante GPT0,306
Écart entre enseignants0,268 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations137
Publié2011
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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