Insights into the Role of Histone H3 and Histone H4 Core Modifiable Residues in <i>Saccharomyces cerevisiae</i>
Notice bibliographique
Résumé
The biological significance of recently described modifiable residues in the globular core of the bovine nucleosome remains elusive. We have mapped these modification sites onto the Saccharomyces cerevisiae histones and used a genetic approach to probe their potential roles both in heterochromatic regions of the genome and in the DNA repair response. By mutating these residues to mimic their modified and unmodified states, we have generated a total of 39 alleles affecting 14 residues in histones H3 and H4. Remarkably, despite the apparent evolutionary pressure to conserve these near-invariant histone amino acid sequences, the vast majority of mutant alleles are viable. However, a subset of these variant proteins elicit an effect on transcriptional silencing both at the ribosomal DNA locus and at telomeres, suggesting that posttranslational modification(s) at these sites regulates formation and/or maintenance of heterochromatin. Furthermore, we provide direct mass spectrometry evidence for the existence of histone H3 K56 acetylation in yeast. We also show that substitutions at histone H4 K91, K59, S47, and R92 and histone H3 K56 and K115 lead to hypersensitivity to DNA-damaging agents, linking the significance of the chemical identity of these modifiable residues to DNA metabolism. Finally, we allude to the possible molecular mechanisms underlying the effects of these modifications.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».