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Enregistrement W2123559159 · doi:10.1128/jvi.03840-13

A Unique N-Terminal Sequence in the Carnation Italian ringspot virus p36 Replicase-Associated Protein Interacts with the Host Cell ESCRT-I Component Vps23

2014· article· en· W2123559159 sur OpenAlexaff
Lynn G.L. Richardson, Eric A. Clendening, Hyukho Sheen, Satinder K. Gidda, K. Andrew White, Robert T. Mullen

Notice bibliographique

RevueJournal of Virology · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Virus Research Studies
Établissements canadiensYork UniversityUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesPurdue University
Mots-clésESCRTBiologyEndosomeCell biologyVirologyViral envelopeViral replicationRNA-dependent RNA polymeraseVirusRNAGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

UNLABELLED: Like most positive-strand RNA viruses, infection by plant tombusviruses results in extensive rearrangement of specific host cell organelle membranes that serve as the sites of viral replication. The tombusvirus Tomato bushy stunt virus (TBSV) replicates within spherules derived from the peroxisomal boundary membrane, a process that involves the coordinated action of various viral and cellular factors, including constituents of the endosomal sorting complex required for transport (ESCRT). ESCRT is comprised of a series of protein subcomplexes (i.e., ESCRT-0 -I, -II, and -III) that normally participate in late endosome biogenesis and some of which are also hijacked by certain enveloped retroviruses (e.g., HIV) for viral budding from the plasma membrane. Here we show that the replication of Carnation Italian ringspot virus (CIRV), a tombusvirus that replicates at mitochondrial membranes also relies on ESCRT. In plant cells, CIRV recruits the ESCRT-I protein, Vps23, to mitochondria through an interaction that involves a unique region in the N terminus of the p36 replicase-associated protein that is not conserved in TBSV or other peroxisome-targeted tombusviruses. The interaction between p36 and Vps23 also involves the Vps23 C-terminal steadiness box domain and not its N-terminal ubiquitin E2 variant domain, which in the case of TBSV (and enveloped retroviruses) mediates the interaction with ESCRT. Overall, these results provide evidence that CIRV uses a unique N-terminal sequence for the recruitment of Vps23 that is distinct from those used by TBSV and certain mammalian viruses for ESCRT recruitment. Characterization of this novel interaction with Vps23 contributes to our understanding of how CIRV may have evolved to exploit key differences in the plant ESCRT machinery. IMPORTANCE: Positive-strand RNA viruses replicate their genomes in association with specific host cell membranes. To accomplish this, cellular components responsible for membrane biogenesis and modeling are appropriated by viral proteins and redirected to assemble membrane-bound viral replicase complexes. The diverse pathways leading to the formation of these replication structures are poorly understood. We have determined that the cellular ESCRT system that is normally responsible for mediating late endosome biogenesis is also involved in the replication of the tombusvirus Carnation Italian ringspot virus (CIRV) at mitochondria. Notably, CIRV recruits ESCRT to the mitochondrial outer membrane via an interaction between a unique motif in the viral protein p36 and the ESCRT component Vps23. Our findings provide new insights into tombusvirus replication and the virus-induced remodeling of plant intracellular membranes, as well as normal ESCRT assembly in plants.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,925
Score d'incertitude au seuil0,308

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,261
Écart entre enseignants0,231 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations47
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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