In Vivo Analysis of <i>Aspergillus fumigatus</i> Developmental Gene Expression Determined by Real-Time Reverse Transcription-PCR
Notice bibliographique
Résumé
Very little is known about the developmental stages of Aspergillus fumigatus during invasive aspergillosis. We performed real-time reverse transcription-PCR analysis on lung samples from mice with invasive pulmonary aspergillosis to determine the expression of A. fumigatus genes that are expressed at specific stages of development. In established infection, A. fumigatus exhibited mRNA expression of genes specific to developmentally competent hyphae, such as stuA. In contrast, mRNA of genes expressed by conidia and precompetent hyphae was not detected. Many genes required for mycotoxin synthesis, including aspHS, gliP, mitF, and metAP, are known to be expressed by developmentally competent hyphae in vitro. Interestingly, each of these genes was expressed at significantly higher levels during invasive infection than in vitro. The expression of gliP mRNA in vitro was found to be highly dependent on culture conditions. Furthermore, gliP expression was found to be dependent on the transcription factor StuA both in vitro and in vivo. Therefore, developmentally competent hyphae predominate during established invasive infection, and many mycotoxin genes are expressed at high levels in vivo. These results highlight the importance of the evaluation of putative virulence factors expressed by competent hyphae and analysis of gene expression levels during invasive infection rather than in vitro alone.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».