Aetiological role of common respiratory viruses in acute lower respiratory infections in children under five years: A systematic review and meta–analysis
Notice bibliographique
Résumé
Aetiological role of common respiratory viruses in acute lower respiratory infections in children under five years: A systematic review and meta-analysisBackground Acute lower respiratory infection (ALRI) remains a major cause of childhood hospitalization and mortality in young children and the causal attribution of respiratory viruses in the aetiology of ALRI is unclear.We aimed to quantify the absolute effects of these viral exposures. MethodsWe conducted a systematic literature review (across 7 databases) of case-control studies published from 1990 to 2014 which investigated the viral profile of 18592 children under 5 years with and without ALRI.We then computed a pooled odds ratio and virusspecific attributable fraction among the exposed of 8 common viruses -respiratory syncytial virus (RSV), influenza (IFV), parainfluenza (PIV), human metapneumovirus (MPV), adenovirus (AdV), rhinovirus (RV), bocavirus (BoV), and coronavirus (CoV).Findings From the 23 studies included, there was strong evidence for causal attribution of RSV (OR 9.79; AFE 90%), IFV (OR 5.10; AFE 80%), PIV (OR 3.37; AFE 70%) and MPV (OR 3.76; AFE 73%), and less strong evidence for RV (OR 1.43; AFE 30%) in young children presenting with ALRI compared to those without respiratory symptoms (asymptomatic) or healthy children.However, there was no significant difference in the detection of AdV, BoV, or CoV in cases and controls. ConclusionsThis review supports RSV, IFV, PIV, MPV and RV as important causes of ALRI in young children, and provides quantitative estimates of the absolute proportion of virus-associated ALRI cases to which a viral cause can be attributed Electronic supplementary material:The online version of this article contains supplementary material.Acute lower respiratory infection (ALRI), including pneumonia, remains the leading cause of childhood hospitalization and mortality in young children (under 5 years old) [1], primarily within developing countries [2].It has been previously estimated that there were 11.9 million and 3.0 million respective episodes of severe and very severe ALRI that contributed to childhood hospitalization globally in 2010 [3].Furthermore, there were 0.935 million attributable deaths in 2013 [4].
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,010 | 0,031 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,016 | 0,039 |
| Bibliométrie | 0,007 | 0,007 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,003 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».