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Enregistrement W2123827865 · doi:10.1139/o11-041

Aggregates with lysozyme and ovalbumin show features of amyloid-like fibrils

2011· article· en· W2123827865 sur OpenAlexvenueno aff
Yasushi Sugimoto, Yoshiki Kamada, Yuhei Tokunaga, Hiroshi Shinohara, Mitsuharu Matsumoto, Takahiro Kusakabe, Takatoshi Ohkuri, Tadashi Ueda

Notice bibliographique

RevueBiochemistry and Cell Biology · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueProteins in Food Systems
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésOvalbuminLysozymeEgg whiteThioflavinChemistryCircular dichroismPeptideFibrilDenaturation (fissile materials)Amyloid (mycology)BiophysicsBiochemistryBiologyNuclear chemistryAntigenImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The interaction of egg-white lysozyme with N-ovalbumin, the native form of egg-white ovalbumin with the denaturation temperature, T(m), of 78 °C, was investigated by the inhibition of lysozyme muramidase activity, differential scanning calorimetry, and circular dichroism assay as indicators. Signals for the interaction were the most prominent when the mixture of lysozyme and N-ovalbumin was co-heated at 72 °C, slightly lower than the T(m) of N-ovalbumin. The interaction was also marked when unheated lysozyme was mixed with N-ovalbumin preheated at 72 °C. Moreover, the mixture rapidly formed fibrous precipitates, which were positive for thioflavin T fluorescent emission, a marker for the amyloid fibril formation. Also electron microscopic observation exhibited features of fibrils. The interaction potency of ovalbumin was ascribed to the tryptic fragment ILELPFASGT MSMLVLLPDE VSGLEQLESIINFEK (residues 229-263), derived from the 2B strands 2 and 3 of ovalbumin. From lysozyme, on the other hand, the chymotryptic peptide RNRCKGTDVQAW (residues 112-123), including cluster 6, and the chymotryptic/tryptic peptide GILQINSRW (residues 54-62), including cluster 3, were responsible for the interaction with N-ovalbumin. Interestingly, this nonamer peptide was found to have the ability to self-aggregate. To the authors knowledge, this may be the first report to document the possible involvement of dual proteins in the formation of amyloid-like fibrils.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,012
Score d'incertitude au seuil0,196

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,192
Écart entre enseignants0,176 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations51
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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