MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2124133814 · doi:10.1186/1476-4598-6-6

Breast cancer metastasis suppressor 1 (BRMS1) inhibits osteopontin transcription by abrogating NF-κB activation

2007· article· en· W2124133814 sur OpenAlexaff
Rajeev S. Samant, David W. Clark, Rebecca A. Fillmore, Muzaffer Cicek, Brandon J. Metge, Kondethimmana H Chandramouli, Ann F. Chambers, Graham Casey, Danny R. Welch, Lalita A. Shevde

Notice bibliographique

RevueMolecular Cancer · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMechanisms of cancer metastasis
Établissements canadiensCancer Care Ontario
Organismes subventionnairesMedical Research and Materiel CommandNational Cancer InstituteNational Foundation for Cancer ResearchU.S. Public Health ServiceSusan G. Komen for the Cure
Mots-clésOsteopontinCancer researchBiologyMetastasisChromatin immunoprecipitationTranscription factorNF-κBPromoterCancerCell biologyGene expressionGeneSignal transductionImmunologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Osteopontin (OPN), a secreted phosphoglycoprotein, has been strongly associated with tumor progression and aggressive cancers. MDA-MB-435 cells secrete very high levels of OPN. However metastasis-suppressed MDA-MB-435 cells, which were transfected with breast cancer metastasis suppressor 1 (BRMS1), expressed significantly less OPN. BRMS1 is a member of mSin3-HDAC transcription co-repressor complex and has been shown to suppress the metastasis of breast cancer and melanoma cells in animal models. Hence we hypothesized that BRMS1 regulates OPN expression. RESULTS: The search for a BRMS1-regulated site on the OPN promoter, using luciferase reporter assays of the promoter deletions, identified a novel NF-kappaB site (OPN/NF-kappaB). Electrophoretic mobility shift assays and chromatin immunoprecipitations (ChIP) confirmed this site to be an NF-kappaB-binding site. We also show a role of HDAC3 in suppression of OPN via OPN/NF-kappaB. CONCLUSION: Our results show that BRMS1 regulates OPN transcription by abrogating NF-kappaB activation. Thus, we identify OPN, a tumor-metastasis activator, as a crucial downstream target of BRMS1. Suppression of OPN may be one of the possible underlying mechanisms of BRMS1-dependent suppression of tumor metastasis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,272
Écart entre enseignants0,262 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations117
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueMolecular CancerMême sujetMechanisms of cancer metastasisTravaux en français237 207