MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2124155120 · doi:10.1128/jcm.00681-08

Rapid Method for Sensitive Screening of Oligosaccharide Epitopes in the Lipooligosaccharide from <i>Campylobacter jejuni</i> Strains Isolated from Guillain-Barre Syndrome and Miller Fisher Syndrome Patients

2008· article· en· W2124155120 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Microbiology · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePeripheral Neuropathies and Disorders
Établissements canadiensNational Research Council CanadaInstitute for Biological Sciences
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCampylobacter jejuniGlycanMicrobiologyChromatographyRNase PMass spectrometryGangliosideMultiplexChemistryBiologyBacteriaBiochemistryBioinformaticsGlycoproteinRNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Campylobacter jejuni lipooligosaccharide (LOS) can trigger Guillain-Barré syndrome (GBS) due to its similarity to human gangliosides. Rapid and accurate structural elucidation of the LOS glycan of a strain isolated from a GBS patient could help physicians determine the spectrum of anti-ganglioside antibodies likely to be found and therefore provide valuable assistance in establishing an appropriate course of treatment. The ability of implemented mass spectrometry-based approaches in a clinical setting has been limited by the laborious and time-consuming nature of the protocols, typically 3 to 4 days, used to prepare LOS. In order to improve the analytical throughput, microwave-assisted enzymatic digestion was investigated. In this study, the bacterial cells were suspended in 50 microl of 20 mM ammonium acetate buffer containing DNase and RNase and treated by direct microwave irradiation for 3 min. Then, proteinase K was added and the samples were again microwaved. The intact LOS samples were analyzed using electrophoresis-assisted open-tubular liquid chromatography-mass spectrometry. The reliability of the rapid, high-throughput technique was demonstrated through analysis of LOS glycans from 73 C. jejuni strains. The structure was elucidated using material from a single colony. The total time for sample preparation and MS analysis is less than 60 min.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,311
Score d'incertitude au seuil0,717

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,040
Tête enseignante GPT0,317
Écart entre enseignants0,277 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle