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Enregistrement W2124165639 · doi:10.1111/j.1442-2050.2006.00586.x

Cdx-2 expression in squamous and metaplastic columnar epithelia of the esophagus

2006· article· en· W2124165639 sur OpenAlexaff
Daniel Vallböhmer, Steven R. DeMeester, Jeffrey H. Peters, Daniel Oh, Hidekazu Kuramochi, Daisuke Shimizu, J. A. Hagen, Kathleen D. Danenberg, P. V. Danenberg, Thomas Demeester, Para Chandrasoma

Notice bibliographique

RevueDiseases of the Esophagus · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDigestive system and related health
Établissements canadiensResponse Biomedical (Canada)
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteNational Institutes of Health
Mots-clésEpitheliumPathologyEsophagusIntestinal metaplasiaIntestinal mucosaMicrodissectionBarrett's esophagusLaser capture microdissectionStratified squamous epitheliumSquamous metaplasiaBiologyCDX2Gene expressionMetaplasiaMedicineHomeoboxInternal medicineDysplasiaGeneAdenocarcinomaCancerGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The molecular pathogenesis of Barrett's esophagus is poorly understood. Evidence suggests that at a phenotypic level, the metaplastic process begins with the transformation of squamous epithelium in the distal esophagus to cardiac mucosa, which subsequently becomes intestinalized. The homeobox gene Cdx-2 has been shown to be an important transcriptional regulator of embryonic differentiation and maintenance of adult intestinal type epithelium. We hypothesized that Cdx-2 gene expression levels increase with the phenotypic transformation of normal squamous mucosa to the intestinalized columnar mucosa of Barrett's esophagus. Endoscopic biopsies were obtained at the gastroesophageal junction in patients with symptoms of gastroesophageal reflux disease and classified according to histology: normal squamous mucosa (n = 62), cardiac mucosa (n = 19), oxynto-cardiac mucosa (n = 14), and intestinal metaplasia (n = 15). Duodenal biopsies (n = 26) served as the columnar control. After laser capture microdissection and RNA isolation, gene expression levels of Cdx-2 were measured in each tissue type by quantitative reverse transcription polymerase chain reaction. Consistent with its known function, Cdx-2 gene expression levels were highest in duodenal mucosa and nearly absent in squamous epithelium. There was a stepwise increase in Cdx-2 gene expression from cardiac to Barrett's epithelium (P < 0.001). Expression levels of Cdx-2 in cardiac and oxynto-cardiac mucosa were 40-70 times higher and Barrett's mucosa 400 times higher than that found in squamous epithelium. Relative expression of the homeobox gene Cdx-2, known to induce differentiation of intestinal type epithelium, increases in a stepwise fashion during the phenotypic transformation of distal esophageal squamous mucosa to cardiac columnar mucosa and to the intestinalized columnar mucosa of Barrett's esophagus. Therefore, Cdx-2 may be a potential biomarker to detect the early transition to Barrett's esophagus.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,186
Score d'incertitude au seuil0,309

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,003
Tête enseignante GPT0,204
Écart entre enseignants0,201 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations65
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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