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Enregistrement W2124173075 · doi:10.1242/jcs.095539

Ciliogenesis in<i>Caenorhabditis elegans</i>requires genetic interactions between ciliary middle segment localized NPHP-2 (inversin) and transition zone-associated proteins

2012· article· en· W2124173075 sur OpenAlexafffund
Simon R. F. Warburton-Pitt, Andrew R. Jauregui, Chunmei Li, Juan Wang, Michel R. Leroux, Maureen M. Barr

Notice bibliographique

RevueJournal of Cell Science · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic and Kidney Cyst Diseases
Établissements canadiensSimon Fraser University
Organismes subventionnairesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of Health
Mots-clésCiliumCiliogenesisNephronophthisisBiologyCaenorhabditis elegansCiliopathyIntraflagellar transportGeneticsMutationGeneCell biologyFlagellumPhenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The cystic kidney diseases nephronophthisis (NPHP), Meckel-Gruber syndrome (MKS) and Joubert syndrome (JBTS) share an underlying etiology of dysfunctional cilia. Patients diagnosed with NPHP type II have mutations in the gene INVS (also known as NPHP2), which encodes inversin, a cilia localizing protein. Here, we show that the C. elegans inversin ortholog, NPHP-2, localizes to the middle segment of sensory cilia and that nphp-2 is partially redundant with nphp-1 and nphp-4 (orthologs of human NPHP1 and NPHP4, respectively) for cilia placement within the head and tail sensilla. nphp-2 also genetically interacts with MKS ciliopathy gene orthologs, including mks-1, mks-3, mks-6, mksr-1 and mksr-2, in a sensilla-dependent manner to control cilia formation and placement. However, nphp-2 is not required for correct localization of the NPHP- and MKS-encoded ciliary transition zone proteins or for intraflagellar transport (IFT). We conclude that INVS/NPHP2 is conserved in C. elegans and that nphp-2 plays an important role in C. elegans cilia by acting as a modifier of the NPHP and MKS pathways to control cilia formation and development.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,213
Score d'incertitude au seuil0,477

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,234
Écart entre enseignants0,222 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations48
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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