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Enregistrement W2124212230 · doi:10.1128/jvi.77.7.3922-3928.2003

Evidence that Binding of Cucumber Necrosis Virus to Vector Zoospores Involves Recognition of Oligosaccharides

2003· article· en· W2124212230 sur OpenAlexafffund
Kishore Kakani, Marjorie Robbins, D’Ann Rochon

Notice bibliographique

RevueJournal of Virology · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Virus Research Studies
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food CanadaUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésZoosporeBiologyFucoseMicrobiologySialic acidMannoseBiochemistryGlycoproteinSpore

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Despite the importance of vectors in natural dissemination of plant viruses, relatively little is known about the molecular features of viruses and vectors that permit their interaction in nature. Cucumber necrosis virus (CNV) is a small spherical virus whose transmission in nature is facilitated by zoospores of the fungus Olpidium bornovanus. Previous studies have shown that specific regions of the CNV capsid are involved in transmission and that transmission defects in several CNV transmission mutants are due to inefficient attachment of virions to the zoospore surface. In this study, we have undertaken to determine if zoospores contain specific receptors for CNV. We show that in vitro binding of CNV to zoospores is saturable and that vector zoospores bind CNV more efficiently than nonvector zoospores. Further studies show that treatment of zoospores with periodate and trypsin reduces CNV binding, suggesting the involvement of glycoproteins in zoospore attachment. In virus overlay assays, CNV binds to several proteins, whereas CNV transmission mutants either fail to bind or bind at significantly reduced levels. The possible involvement of specific sugars in attachment was investigated by incubating CNV with zoospores in the presence of various sugars. Two mannose derivatives (methyl alpha-D-mannopyranoside and D-mannosamine), as well as three mannose-containing oligosaccharides (mannotriose, alpha3,alpha6-mannopentaose, and yeast mannan) and L-(-)-fucose, all inhibited CNV binding at relatively low concentrations. Taken together, our studies suggest that binding of CNV to zoospores is mediated by specific mannose and/or fucose-containing oligosaccharides. This is the first time sugars have been implicated in transmission of a plant virus.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,124
Score d'incertitude au seuil0,371

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,144
Tête enseignante GPT0,306
Écart entre enseignants0,162 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations35
Publié2003
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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