MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2124225477 · doi:10.3748/wjg.14.5217

Efflux pump gene hefA of Helicobacter pylori plays an important role in multidrug resistance

2008· article· en· W2124225477 sur OpenAlexaff
Zhiqiang Liu, Pengyuan Zheng, Ping–Chang Yang

Notice bibliographique

RevueWorld Journal of Gastroenterology · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHelicobacter pylori-related gastroenterology studies
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésEffluxMultiple drug resistanceMicrobiologyBiologyTetracyclineAgar dilutionErythromycinAntibioticsHelicobacter pyloriKanamycinMinimum inhibitory concentrationGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

AIM: To determine whether efflux systems contribute to multidrug resistance of H pylori. METHODS: A chloramphenicol-induced multidrug resistance model of six susceptible H pylori strains (5 isolates and H pylori NCTC11637) was developed. Multidrug-resistant (MDR) strains were selected and the minimal inhibitory concentration (MIC) of erythromycin, metronidazole, penicillin G, tetracycline, and ciprofloxacin in multidrug resistant strains and their parent strains was determined by agar dilution tests. The level of mRNA expression of hefA was assessed by fluorescence real-time quantitative PCR. A H pylori LZ1026 knockout mutant (delta H pylori LZ1026) for (putative) efflux protein was constructed by inserting the kanamycin resistance cassette from pEGFP-N2 into hefA, and its susceptibility profiles to 10 antibiotics were evaluated. RESULTS: The MIC of six multidrug-resistant strains (including 5 clinical isolates and H pylori NCTC11637) increased significantly (>or=4-fold) compared with their parent strains. The expression level of hefA gene was significantly higher in the MDR strains than in their parent strains (P=0.033). A H pylori LZ1026 mutant was successfully constructed and the delta H pylori LZ1026 was more susceptible to four of the 10 antibiotics. All the 20 strains displayed transcripts for hefA that confirmed the in vitro expression of these genes. CONCLUSION: The efflux pump gene hefA plays an important role in multidrug resistance of H pylori.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,026
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,253
Écart entre enseignants0,238 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations94
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueWorld Journal of GastroenterologyMême sujetHelicobacter pylori-related gastroenterology studiesTravaux en français237 207