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Enregistrement W2124357755 · doi:10.1002/pmic.201200415

Phosphoproteome analysis of an early onset mouse model (<scp>T</scp>g<scp>CRND</scp>8) of <scp>A</scp>lzheimer's disease reveals temporal changes in neuronal and glia signaling pathways

2013· article· en· W2124357755 sur OpenAlexafffund
Fangjun Wang, Alexandre P. Blanchard, Fred Elisma, Matthew Granger, Hongbin Xu, Steffany A. L. Bennett, Daniel Figeys, Hanfa Zou

Notice bibliographique

RevuePROTEOMICS · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAlzheimer's disease research and treatments
Établissements canadiensUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésNeurosciencePhosphorylationHippocampal formationHippocampusEntorhinal cortexChemistryAlzheimer's diseaseProteomicsCognitive declineSignal transductionBiochemistryBiologyDiseaseDementiaMedicineInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Sustained exposure to soluble amyloid β (Aβ42 ) oligomers is predicted to impair synaptic function in the hippocampal-entorhinal circuit, signaling synaptic loss and precipitating cognitive impairment in Alzheimer's disease. Regional changes in overall patterns of protein phosphorylation are likely crucial to promote transition from a presymptomatic to a symptomatic state in response to accumulating Aβ42. Here, we used unbiased proteomic approaches to compare the phosphoproteome of presymptomatic and symptomatic TgCRND8 mice and identify network disruptions in signaling pathways implicated in the manifestation of behavioral indices of learning and memory impairment. Phosphopeptide enrichment with triple isotopic dimethylation labeling combined with online multidimensional separation and MS was used to profile phosphoproteome changes in 2- and 6-month-old TgCRND8 mice and congenic littermate controls. We identified 1026 phosphopeptides representing 1168 phosphorylation sites from 476 unique proteins. Of these, 595 phosphopeptides from 293 unique proteins were reliably quantified and 139 phosphopeptides were found to change significantly in the hippocampus of TgCRND8 mice following conversion from a presymptomatic to a symptomatic state.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,347
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,032
Tête enseignante GPT0,272
Écart entre enseignants0,241 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations21
Publié2013
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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