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Enregistrement W2124455757 · doi:10.1039/c5mb00488h

Computational modeling of cytokine signaling in microglia

2015· article· en· W2124455757 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueMolecular BioSystems · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNeuroinflammation and Neurodegeneration Mechanisms
Établissements canadiensMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesNational Heart, Lung, and Blood InstituteCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésNeuroinflammationMicrogliaNeuroscienceCytokineCell biologySignal transductionImmunologyBiologyComputational biologyChemistryInflammation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Neuroinflammation due to glial activation has been linked to many CNS diseases. We developed a computational model of a microglial cytokine interaction network to study the regulatory mechanisms of microglia-mediated neuroinflammation. We established a literature-based cytokine network, including TNFα, TGFβ, and IL-10, and fitted a mathematical model to published data from LPS-treated microglia. The addition of a previously unreported TGFβ autoregulation loop to our model was required to account for experimental data. Global sensitivity analysis revealed that TGFβ- and IL-10-mediated inhibition of TNFα was critical for regulating network behavior. We assessed the sensitivity of the LPS-induced TNFα response profile to the initial TGFβ and IL-10 levels. The analysis showed two relatively shifted TNFα response profiles within separate domains of initial condition space. Further analysis revealed that TNFα exhibited adaptation to sustained LPS stimulation. We simulated the effects of functionally inhibiting TGFβ and IL-10 on TNFα adaptation. Our analysis showed that TGFβ and IL-10 knockouts (TGFβ KO and IL-10 KO) exert divergent effects on adaptation. TFGβ KO attenuated TNFα adaptation whereas IL-10 KO enhanced TNFα adaptation. We experimentally tested the hypothesis that IL-10 KO enhances TNFα adaptation in murine macrophages and found supporting evidence. These opposing effects could be explained by differential kinetics of negative feedback. Inhibition of IL-10 reduced early negative feedback that results in enhanced TNFα-mediated TGFβ expression. We propose that differential kinetics in parallel negative feedback loops constitute a novel mechanism underlying the complex and non-intuitive pro- versus anti-inflammatory effects of individual cytokine perturbations.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,084
Score d'incertitude au seuil0,447

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,052
Tête enseignante GPT0,266
Écart entre enseignants0,214 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle