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Enregistrement W2124570436 · doi:10.1111/mec.13163

Repeatability, ephemerality and inconvenient truths in the speciation process

2015· letter· en· W2124570436 sur OpenAlexafffund
Asher D. Cutter

Notice bibliographique

RevueMolecular Ecology · 2015
Typeletter
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic diversity and population structure
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésBiologyEvolutionary biologyGenetic algorithmPopulationNatural selectionEcological speciationEcologyCharacter displacementReproductive isolationGene flowGenetic variationSympatric speciationSympatryGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Everyone appreciates the happy fiction that species conform to the simple theoretical convenience of a single panmictic population. In speciation genetics, a further standard simplification is that it is only those genetic differences that are fixed between diverging populations that need concern us in order to understand the accumulation of intrinsic barriers to reproduction. To a first approximation, of course, both of these assumptions are appropriate and theory based on them provides compelling insights into diverse evolutionary phenomena (Orr & Turelli ). But what else can we learn about the begetting of biodiversity, speciation, by considering explicitly some less convenient realities of natural populations? Specifically, how does genetic variation at incompatibility loci within a species influence interspecies hybridization upon secondary contact? And, in nature, how repeatable among distinct bouts of secondary contact are the genomic outcomes of hybridization? Mandeville et al. () tackle exactly this question in their new study in Molecular Ecology on five species of suckers, fish of the genus Catostomus, that overlap sympatrically in different portions of their subdivided ranges that occupy different rivers. They document substantial genomic heterogeneity in realized hybridization in nature, both among species pairs and among the source populations for hybrids of a given species pair. This imperfect repeatability of episodes of hybridization implies greater permeability of species barriers in some parts of their range, with intriguing consequences for how the integrity of species as independently evolving units could be susceptible to collapse.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,017
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,041
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Théorique ou conceptuel · Signal consensuel: Théorique ou conceptuel
GenreSignal candidat: Commentaire · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,017
Score d'incertitude au seuil0,090

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0170,041
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0040,062
Communication savante0,0050,016
Science ouverte0,0020,005
Intégrité de la recherche0,0030,006
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,257
Écart entre enseignants0,242 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeThéorique ou conceptuel
Domainenon disponible
GenreCommentaire

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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