Rituximab Therapy Leads to Reduced Imprints of Receptor Revision in Immunoglobulin κ and λ Light Chains
Notice bibliographique
Résumé
OBJECTIVE: Transient B cell depletion by rituximab (RTX) has become a specific treatment of rheumatoid arthritis (RA). Although phenotypic repopulation kinetics of B cell subsets are well documented, precise molecular analyses of the reconstituting immunoglobulin (Ig) genes encoding the B cell receptor in RA are sparse. METHODS: A total of 708 individual CD19+CD27+ (memory) and CD19+CD27- (naive) B cells from 2 patients with RA were analyzed at baseline and 7 months after RTX at B cell repopulation. Ig light chain variable kappa (Vκ) and lambda (Vλ) light chain gene rearrangements were amplified, sequenced, and analyzed with a focus on receptor revision. RESULTS: The naive as well as the memory repertoire repopulated polyclonally with diverse use of variable light chain gene families and minigenes. During the reconstitution phase, B cells used significantly fewer Jκ distal Vκ genes (p = 0.0006), with a higher frequency of somatic hypermutation of rearrangements employing Jκ5 compared to baseline in memory B cells. The use of Vλ rearrangements in regenerating B cells was also biased toward use of Vλ genes of the proximal cassette. In general, reemerging CD27+ Ig light chain genes were substantially more highly mutated than before RTX therapy (p < 0.0001, baseline vs during reconstitution). CONCLUSION: Our data indicate that RTX therapy leads to generation of distinct Vκ/Jκ and Vλ/Jλ gene repertoires consistent with replenishment of antigen-experienced B cells by germinal centers. At baseline, the imprints of receptor revision appeared to be more striking, which indicates that receptor revision is active in patients with RA and can be reduced by RTX.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».