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Enregistrement W2124716519 · doi:10.1186/1745-6150-4-48

Depauperate genetic variability detected in the American and European bison using genomic techniques

2009· article· en· W2124716519 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueBiology Direct · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic and phenotypic traits in livestock
Établissements canadiensCanadian Blood ServicesUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesZoologische Gesellschaft FrankfurtEuropean Science Foundation
Mots-clésBiologyLinkage disequilibriumHaplotypeGenetic diversityEvolutionary biologySingle-nucleotide polymorphismGenotypingSelection (genetic algorithm)GenomeGeneticsPopulationAlleleGenotypeGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A total of 929 polymorphic SNPs in EB (out of 54, 000 SNPs screened using a BovineSNP50 Illumina Genotyping BeadChip), and 1, 524 and 1, 403 polymorphic SNPs in WB and PB, respectively, were analysed. EB, WB and PB have all undergone recent drastic reductions in population size. Accordingly, they exhibited extremely depauperate genomes, deviations from genetic equilibrium and a genome organization consisting of a mosaic of haplotype blocks: regions with low haplotype diversity and high levels of linkage disequilibrium. No evidence for positive or stabilizing selection was found in EB, WB and PB, likely reflecting drift overwhelming selection. We suggest that utilization of genome-wide screening technologies, followed by utilization of less expensive techniques (e.g. VeraCode and Fluidigm EP1), holds large potential for genetic monitoring of populations. Additionally, these techniques will allow radical improvements of breeding practices in captive or managed populations, otherwise hampered by the limited availability of polymorphic markers. This result in improved possibilities for 1) estimating genetic relationships among individuals and 2) designing breeding strategies which attempt to preserve or reduce polymorphism in ecologically relevant genes and/or entire blocks.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,928
Score d'incertitude au seuil0,428

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,257
Écart entre enseignants0,246 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle