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Enregistrement W2124724858 · doi:10.1373/clinchem.2008.117465

New Dual Monoclonal ELISA for Measuring Plasma Osteopontin as a Biomarker Associated with Survival in Prostate Cancer: Clinical Validation and Comparison of Multiple ELISAs

2009· article· en· W2124724858 sur OpenAlexaff
Pieter H. Anborgh, Sylvia M. Wilson, Alan B. Tuck, Eric Winquist, Nancy Schmidt, R. W. Hart, Shigeyuki Kon, Masahiro Maeda, Toshimitsu Uede, Larry Stitt, Ann F. Chambers

Notice bibliographique

RevueClinical Chemistry · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBone and Dental Protein Studies
Établissements canadiensWestern UniversityLondon Health Sciences Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésProstate cancerOsteopontinBiomarkerMonoclonal antibodyMedicineOncologyMonoclonalCancer biomarkersCancerInternal medicineImmunologyBiologyAntibody

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: A previously developed monoclonal/polyclonal ELISA (Mono/Poly) to detect plasma concentrations of osteopontin (OPN) was shown to provide prognostic information in breast, prostate, and other cancers. Here we describe the clinical validation of a new dual monoclonal (Dual Mono) assay. We compared both assays with 4 assays that recognize defined regions of OPN protein (dual polyclonal systems 5-1, 4-1, 4-3 and polyclonal-monoclonal system 1-3). METHODS: OPN sequences recognized by the monoclonal antibodies that make up the Dual Mono ELISA were identified by Pepscan CLIPS analysis. Using the 6 ELISAs, we measured OPN in plasma from 66 patients with castration-resistant prostate cancer, and we assessed the ability of each assay to predict patient survival. RESULTS: The assays varied in measured plasma OPN concentrations, with median values ranging from 112 to 1740 mug/L, and ability to predict patient survival. By Cox univariable regression of survival by tertiles of OPN, the Mono/Poly and Dual Mono ELISAs had the highest log-rank chi(2) values. After adjustment for risk factors independently associated with survival in our samples, OPN remained associated with survival only for the Mono/Poly and Dual Mono systems. CONCLUSIONS: OPN plasma values varied significantly depending on the assay used. Only the Mono/Poly and Dual Mono systems were independently associated with survival in a population of men with castration-resistant prostate cancer. The availability of a clinically validated, dual monoclonal-based ELISA will provide consistent reagents for studies of OPN plasma concentrations in cancer and other pathologies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,013

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,122
Tête enseignante GPT0,412
Écart entre enseignants0,290 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations45
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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