Protein composition of human epididymosomes collected during surgical vasectomy reversal: a proteomic and genomic approach
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: The epididymal epithelium secretes membranous vesicles, called epididymosomes, with which a complex mixture of proteins is associated. These vesicles transfer to spermatozoa selected proteins involved in sperm maturation. Epididymosomes in the human excurrent duct have been described, but their protein composition and possible functions are unknown. METHODS AND RESULTS: Epididymosomes were collected during vasovasostomy procedures, purified and submitted to liquid chromatography with hybrid quadrupole time-of-flight mass spectrometry. From all the mass spectra generated, 1022 peptides allowed the identification of 146 different proteins. Identification of some of these proteins was confirmed by western blots. Furthermore, western blot showed that the protein composition of epididymosomes differed from that characterizing prostasomes; membranous vesicles secreted by the prostate. Organization of the epididymosomes proteome according to common functional features suggests that epididymosomes have multiple functions. In order to understand the origin of epididymosomes collected distally, microarray databases of caput, corpus and cauda epididymidis were analysed to determine where along the excurrent duct the encoded proteins associated to epididymosomes are synthesised. Results suggest that some proteins synthesized in the caput and corpus epididymidis are associated with epididymosomes collected distally. CONCLUSIONS: Epididymosomes thus transit along the excurrent duct, and vesicles collected distally represent a mixed population.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».