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Enregistrement W2124793489 · doi:10.1002/ibd.22860

Alterations in the gut microbiome of children with severe ulcerative colitis

2011· article· en· W2124793489 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueInflammatory Bowel Diseases · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGut microbiota and health
Établissements canadiensUniversity of AlbertaChildren's Hospital of Eastern OntarioHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesNational Center for Complementary and Integrative HealthNational Center for Complementary and Alternative MedicineNational Institutes of HealthUniversity of AlbertaAlberta InnovatesAlberta Innovates - Health Solutions
Mots-clésMicrobiomeUlcerative colitisFecesGastroenterologyInternal medicineProspective cohort studyInflammatory bowel diseaseBiologyMedicinePathogenesisImmunologyDiseaseBioinformaticsMicrobiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Although the role of microbes in disease pathogenesis is well established, data describing the variability of the vast microbiome in children diagnosed with ulcerative colitis (UC) are lacking. This study characterizes the gut microbiome in hospitalized children with severe UC and determines the relationship between microbiota and response to steroid therapy. METHODS: Fecal samples were collected from 26 healthy controls and 27 children hospitalized with severe UC as part of a prospective multicenter study. DNA extraction, polymerase chain reaction (PCR) amplification of bacterial 16S rRNA, and microarray hybridization were performed. Results were analyzed in GeneSpring GX 11.0 comparing healthy controls with children with UC, and steroid responsive (n = 17) with nonresponsive patients (n = 10). RESULTS: Bacterial signal strength and distribution showed differences between UC and healthy controls (adjusted P < 0.05) for Phylum, Class, Order, Family, Genus, and Phylospecies levels with reduction in Clostridia and an increase in Gamma-proteobacteria. The number of microbial phylospecies was reduced in UC (266 ± 69) vs. controls (758 ± 3, P < 0.001), as was the Shannon Diversity Index (6.1 ± 0.23 vs. 6.49 ± 0.04, respectively; P < 0.0001). Steroid nonresponders harbored fewer phylospecies than responders (142 ± 49 vs. 338 ± 62, P = 0.013). CONCLUSIONS: Richness, evenness, and biodiversity of the gut microbiome were remarkably reduced in children with UC compared with healthy controls. Children who did not respond to steroids harbored a microbiome that was even less rich than steroid responders. This study is the first to characterize the gut microbiome in a large cohort of pediatric patients with severe UC and describes changes in the gut microbiome as a potential prognostic feature.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,115
Score d'incertitude au seuil0,344

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,227
Écart entre enseignants0,218 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle