Characterization of the Intrinsic and TSC2-GAP–Regulated GTPase Activity of Rheb by Real-Time NMR
Notice bibliographique
Résumé
Tuberous sclerosis complex 2 (TSC2), whose gene is frequently mutated in tuberous sclerosis, increases the guanosine triphosphatase (GTPase) activity of the small heterotrimeric GTP-binding protein (G protein) Rheb, thus resulting in the decreased activity of the mammalian target of rapamycin (mTOR), the master regulator of cell growth. Here, we describe the development of a nuclear magnetic resonance (NMR)-based, quantitative, real-time assay to explore the molecular mechanism of the intrinsic and TSC2-catalyzed GTPase activity of Rheb. We confirmed that TSC2 accelerated GTP hydrolysis by Rheb 50-fold through an "asparagine-thumb" mechanism to substitute for the nonfunctional "catalytic" glutamine of Rheb and we determined that catalysis was enthalpy driven. Most, but not all, of the disease-associated GTPase-activating protein (GAP) domain mutants of TSC2 that we examined affected its enzymatic activity. This method can now be applied to study the function and regulation of other GTPases.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».