CpG Methylation Modifies the Genetic Stability of Cloned Repeat Sequences
Notice bibliographique
Résumé
The genetic stability of tandemly repeated DNAs is affected by repeat sequence, tract length, tract purity, and replication direction. Alterations in DNA methylation status are thought to influence many processes of mutagenesis. By use of bacterial and primate cell systems, we have determined the effect of CpG methylation on the genetic stability of cloned di-, tri-, penta- and minisatellite repeated DNA sequences. Depending on the repeat sequence, methylation can significantly enhance or reduce its genetic stability. This effect was evident when repeat tracts were replicated from either direction. Unexpectedly, methylation of adjacent sequences altered the stability of contiguous repeat sequences void of methylatable sites. Of the seven repeat sequences investigated, methylation stabilized five, destabilized one, and had no effect on another. Thus, although methylation generally stabilized repeat tracts, its influence depended on the sequence of the repeat. The current results lend support to the notion that the biological consequences of CpG methylation may be affected through local alterations of DNA structure as well as through direct protein-DNA interactions. In vivo CpG methylation in bacteria may have technical applications for the isolation and stable propagation of DNA sequences that have been recalcitrant to isolation and/or analyses because of their extreme instability.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».