MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2125110604 · doi:10.1542/peds.2010-0687

Evidence for an Association Between Infant Mortality and a Carnitine Palmitoyltransferase 1A Genetic Variant

2010· article· en· W2125110604 sur OpenAlexaboutno aff
Bradford D. Gessner, Melanie B. Gillingham, Stephanie Birch, Thalia Wood, David M. Koeller

Notice bibliographique

RevuePEDIATRICS · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMetabolism and Genetic Disorders
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesMaternal and Child Health BureauU.S. Public Health ServiceHealth Resources and Services Administration
Mots-clésMedicineInfant mortalityNewborn screeningGenotypingSudden infant death syndromeIndigenousDemographyMortality rateAllele frequencyAllelePediatricsPopulationGenotypeGeneticsEnvironmental healthInternal medicineBiologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVE: Alaska Native and other circumpolar indigenous populations have historically experienced high infant mortality rates, for unknown reasons. Through routine newborn screening, Alaskan and Canadian indigenous infants have been found to have a high frequency of a single sequence variant (c.1436C→T) in the gene coding for carnitine palmitoyltransferase type 1A (CPT1A). We sought to determine whether these 2 findings were related. METHODS: As part of a quality control exercise at the Alaskan Newborn Metabolic Screening Program, we conducted genotyping for 616 consecutively born, Alaska Native infants and reviewed their medical records. We conducted an ecological analysis comparing Census area-level variant CPT1A allele frequency and historical Alaska Native infant, postneonatal, and neonatal mortality rates. RESULTS: Infant death was identified for 5 of 152 infants homozygous for the c.1436C→T sequence variant (33 deaths per 1000 live births), 2 of 219 heterozygous infants (9 deaths per 1000 live births), and 0 of 245 infants carrying no copies of the variant allele (χ(2) = 9.2; P = .01). All 7 cases of infant death had some evidence of an infectious process at the time of death, including 5 with respiratory infections. Census areas with the highest frequency of the variant allele had the highest historical infant, postneonatal, and neonatal mortality rates. CONCLUSIONS: Our data provide preliminary evidence that a highly prevalent CPT1A variant found among Alaska Native and other indigenous circumpolar populations may help explain historically high infant mortality rates. Larger definitive studies are needed.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,037
Tête enseignante GPT0,312
Écart entre enseignants0,275 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations33
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuePEDIATRICSMême sujetMetabolism and Genetic DisordersTravaux en français237 207