Integrating data on the Arabidopsis NPR1/NPR3/NPR4 salicylic acid receptors; a differentiating argument
Notice bibliographique
Résumé
Salicylic acid (SA) is a mandatory plant metabolite in the deployment of systemic acquired resistance (SAR), a broad-spectrum systemic immune response induced by local inoculation with avirulent pathogens. The NPR1 transcription co-activator is the central node positively regulating SAR. SA was the last of the major hormones to be without a known receptor. Recently, NPR1 was shown to be the direct link between SA and gene activation. This discovery seems to be controversial. NPR1 being an SA-receptor is reminiscent of the mammalian steroid receptors, which are transcription factors whose binding to DNA is dependent on the interaction with a ligand. Unlike steroid receptors, NPR1 does not bind directly to DNA, but is recruited to promoters by the TGA family of transcription factors to form an enhanceosome. In Arabidopsis, NPR1 is part of a multigene family in which two other members, NPR3 and NPR4, have also been shown to interact with SA. NPR3/NPR4 are negative regulators of immunity and act as substrate adaptors for the recruitment of NPR1 to an E3-ubiquitin ligase, leading to its subsequent degradation by the proteasome. In this perspective, we will stress-test in a friendly way the current NPR1/NPR3/NPR4 model.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».