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Enregistrement W2125181296 · doi:10.1158/1078-0432.ccr-10-1434

Urine Metabolite Analysis Offers Potential Early Diagnosis of Ovarian and Breast Cancers

2010· article· en· W2125181296 sur OpenAlexaff
Carolyn M. Slupsky, Helen Steed, Tiffany Wells, Kelly Dabbs, Alexandra Schepansky, Valerie Capstick, Wylam Faught, Michael B. Sawyer

Notice bibliographique

RevueClinical Cancer Research · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMetabolomics and Mass Spectrometry Studies
Établissements canadiensMetabolistics (Canada)University of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésUrineMetaboliteMedicineBreast cancerInternal medicineOncologyCancer

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PURPOSE: Metabolomics is a new, rapidly expanding field dedicated to the global study of metabolites in biological systems. In this article metabolomics is applied to find urinary biomarkers for breast and ovarian cancer. EXPERIMENTAL DESIGN: Urine samples were collected from early- and late-stage breast and ovarian cancer patients during presurgical examinations and randomly from females with no known cancer. After quantitatively measuring a set of metabolites using nuclear magnetic resonance spectroscopy, both univariate and multivariate statistical analyses were employed to determine significant differences. RESULTS: Metabolic phenotypes of breast and ovarian cancers in comparison with normal urine and with each other revealed significance at Bonferroni-corrected significance levels resulting in unique metabolite patterns for breast and ovarian cancer. Intermediates of the tricarboxylic acid cycle and metabolites relating to energy metabolism, amino acids, and gut microbial metabolism were perturbed. CONCLUSIONS: The results presented here illustrate that urinary metabolomics may be useful for detecting early-stage breast and ovarian cancer.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,047
Tête enseignante GPT0,426
Écart entre enseignants0,379 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations243
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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