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Enregistrement W2125185693 · doi:10.1074/jbc.m404206200

The Kinase Activity of Rip1 Is Not Required for Tumor Necrosis Factor-α-induced IκB Kinase or p38 MAP Kinase Activation or for the Ubiquitination of Rip1 by Traf2

2004· article· en· W2125185693 sur OpenAlexaboutno aff
Thomas H. Lee, Jennifer Shank, Nicole Cusson, Michelle A. Kelliher

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCell death mechanisms and regulation
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of General Medical SciencesNational Institutes of Health
Mots-clésMAP kinase kinase kinaseCyclin-dependent kinase 9ASK1Cell biologyMAP2K7Mitogen-activated protein kinase kinaseBiologyKinaseUbiquitin ligaseCyclin-dependent kinase 2Cancer researchUbiquitinCyclin-dependent kinase 4IκB kinaseAutophosphorylationProtein kinase ASignal transductionChemistryBiochemistryNF-κB

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The death domain kinase Rip1 is recruited to the tumor necrosis factor receptor type 1 and mediates the IkappaB kinase and p38 MAP kinase pathways. In response to tumor necrosis factor-alpha (TNF-alpha), we find Rip1 phosphorylated and ubiquitinated, suggesting that Rip1 phosphorylation may stimulate its ubiquitination. To address the contribution of the kinase activity of Rip1 to its ubiquitination and to TNF-alpha signaling, we introduced wild type Rip1 and a kinase-inactive form of Rip1, Rip1D138N, into rip1-/- murine embryonic fibroblast cells by retroviral infection. TNF-alpha-induced ubiquitination of Rip1 is observed in Rip1D138N cells, supporting the argument that Rip1 autophosphorylation is not required for Rip1 ubiquitination. TNF-alpha-induced Ikk and p38 MAP kinase activation is normal, and the Rip1D138N cells are resistant to TNF-alpha-induced cell death, indicating that the kinase activity of Rip1 is not required to mediate its antiapoptotic functions. In the absence of Traf2, TNF-alpha-induced ubiquitination of Rip1 is impaired, suggesting that Traf2 may be the E3 ubiquitin ligase responsible for the TNF-alpha-dependent, ubiquitination of Rip1. Finally, recruitment of the ubiquitinated Tak1 complex is dependent on the presence of Rip1, suggesting that Rip1 ubiquitination rather than its phosphorylation is critical in signaling.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,013

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,044
Tête enseignante GPT0,292
Écart entre enseignants0,249 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations254
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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