Analysis of phenotypic and genetic variations among populations of <i>Oryza malampuzhaensis</i> show evidence of altitude-dependent genetic changes
Notice bibliographique
Résumé
Oryza malampuzhaensis Krish. et Chand., one of the tetraploid taxa in the genus Oryza (Poaceae), is geographically restricted to Western Ghats, southern India. This is one of the poorly understood taxa in the genus, and not much is known about the nature and distribution of its genetic diversity. Five individuals each were selected randomly from 11 populations of O. malampuzhaensis from different altitudinal habitats and were grown in a common-garden experiment for 3 years (1994-1997). Sixty morphological traits and 87 random amplified polymorphic DNA (RAPD) markers, generated by 14 random primers, were used to study the genetic variation among the populations. Elevation-dependent phenotypic variation was observed for a suite of metric traits. A scatterplot of mean values for these traits separated the populations from low, middle, and high altitudes into distinct groups. Cluster analysis using RAPD distance grouped the populations according to their altitudinal habitat, and a similar pattern of clustering was observed with respect to morphological distance also. The mean of both RAPD- and morphology-based pairwise genetic distance of populations belonging to similar altitudinal levels differed significantly. These estimates also depicted a significant decrease in genetic distance with increasing altitude. The results demonstrate that (i) effective isolation from gene flow coupled with natural selection governs genetic structure in O. malampuzhaensis and (ii) ecological heterogeneity associated with elevational gradient has a crucial role in the evolution of O. malampuzhaensis.Key words: Oryza malampuzhaensis, altitude, RAPD, morphological traits, genetic variations, molecular ecology.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».