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Enregistrement W2125236492 · doi:10.1073/pnas.0501536102

A common haplotype in the complement regulatory gene factor H ( <i>HF1/CFH</i> ) predisposes individuals to age-related macular degeneration

2005· article· en· W2125236492 sur OpenAlexfundno aff
Gregory S. Hageman, Don H. Anderson, Lincoln V. Johnson, Lisa S. Hancox, Andrew J. Taiber, Lisa I. Hardisty, Jill L. Hageman, Heather Stockman, James D. Borchardt, Karen M. Gehrs, Richard J. Smith, Giuliana Silvestri, Stephen R. Russell, Caroline C. W. Klaver, Irene Barbazetto, Stanley Chang, Lawrence A. Yannuzzi, Gaetano R. Barile, John C. Merriam, R. Theodore Smith, Adam Olsh, Julie Bergeron, Jana Zernant, Joanna E. Merriam, Bert Gold, Michael Dean, Rando Allikmets

Notice bibliographique

RevueProceedings of the National Academy of Sciences · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRetinal Diseases and Treatments
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Eye InstituteNational Cancer InstituteU.S. Department of Health and Human ServicesNational Institutes of HealthQueen's UniversityRetina Research FoundationResearch to Prevent Blindness
Mots-clésHaplotypeMacular degenerationFactor HDrusenBiologySingle-nucleotide polymorphismGeneticsLocus (genetics)Odds ratioComplement factor BAlleleGenotypeGeneComplement systemMedicinePathologyAntibodyOphthalmology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Age-related macular degeneration (AMD) is the most frequent cause of irreversible blindness in the elderly in developed countries. Our previous studies implicated activation of complement in the formation of drusen, the hallmark lesion of AMD. Here, we show that factor H (HF1), the major inhibitor of the alternative complement pathway, accumulates within drusen and is synthesized by the retinal pigmented epithelium. Because previous linkage analyses identified chromosome 1q25-32, which harbors the factor H gene (HF1/CFH), as an AMD susceptibility locus, we analyzed HF1 for genetic variation in two independent cohorts comprised of approximately 900 AMD cases and 400 matched controls. We found association of eight common HF1 SNPs with AMD; two common missense variants exhibit highly significant associations (I62V, chi2 = 26.1 and P = 3.2 x 10(-7) and Y402H, chi2 = 54.4 and P = 1.6 x 10(-13)). Haplotype analysis reveals that multiple HF1 variants confer elevated or reduced risk of AMD. One common at-risk haplotype is present at a frequency of 50% in AMD cases and 29% in controls [odds ratio (OR) = 2.46, 95% confidence interval (1.95-3.11)]. Homozygotes for this haplotype account for 24% of cases and 8% of controls [OR = 3.51, 95% confidence interval (2.13-5.78)]. Several protective haplotypes are also identified (OR = 0.44-0.55), further implicating HF1 function in the pathogenetic mechanisms underlying AMD. We propose that genetic variation in a regulator of the alternative complement pathway, when combined with a triggering event, such as infection, underlie a major proportion of AMD in the human population.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,054
Tête enseignante GPT0,340
Écart entre enseignants0,286 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1 968
Publié2005
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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