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Enregistrement W2125285974 · doi:10.1095/biolreprod.106.059246

Gene Expression Profiling and Its Relevance to the Blood-Epididymal Barrier in the Human Epididymis1

2007· article· en· W2125285974 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueBiology of Reproduction · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueBarrier Structure and Function Studies
Établissements canadiensMcGill UniversityRoyal Victoria HospitalArmand Frappier MuseumInstitut National de la Recherche Scientifique
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTight junctionOccludinBiologyClaudinEpididymisCell biologyCell junctionCadherinMicroarray analysis techniquesGene expression profilingGeneTranscytosisGene expressionGeneticsCell

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The luminal environment along the epididymal duct is important for spermatozoal maturation. This environment is unique and created by the blood-epididymal barrier, which is formed by tight and adhering junctions. For the human epididymis, little information exists on the proteins that comprise these junctions. Our objectives were to assess the gene expression profiles in the different segments of the human epididymis and to identify the proteins that make up the blood-epididymal barrier. Using microarrays, we identified 2980 genes that were differentially expressed by at least 2-fold between the various segments. Of the many genes involved in diverse functions, were those that encoded adhesion proteins (cadherins and catenins) and tight junctional proteins (claudins [CLDN] and others). PCR analyses confirmed the microarray data. Immunolocalization of CLDNs 1, 3, 4, 8, and 10 revealed that the localization of CLDNs differed along the epididymis. In all three segments, CLDNs 1, 3, and 4 were localized to tight junctions, along the lateral margins of adjacent principal cells, and at the interface between basal and principal cells. CLDN8 was localized to tight junctions in all three segments, in addition to being localized in the caput along the lateral margins of principal cells, and in the corpus, at the interface between principal and basal cells. CLDN10, tight junction protein 1, and occludin were localized exclusively to tight junctions in all three epididymal segments. These data indicate that the epididymis displays a complex pattern of gene expression, which includes genes that are implicated in the formation of the blood-epididymal barrier, which suggests complex regulation of this barrier.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,021
Score d'incertitude au seuil0,246

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,044
Tête enseignante GPT0,307
Écart entre enseignants0,263 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle