Gene Expression Profiling and Its Relevance to the Blood-Epididymal Barrier in the Human Epididymis1
Notice bibliographique
Résumé
The luminal environment along the epididymal duct is important for spermatozoal maturation. This environment is unique and created by the blood-epididymal barrier, which is formed by tight and adhering junctions. For the human epididymis, little information exists on the proteins that comprise these junctions. Our objectives were to assess the gene expression profiles in the different segments of the human epididymis and to identify the proteins that make up the blood-epididymal barrier. Using microarrays, we identified 2980 genes that were differentially expressed by at least 2-fold between the various segments. Of the many genes involved in diverse functions, were those that encoded adhesion proteins (cadherins and catenins) and tight junctional proteins (claudins [CLDN] and others). PCR analyses confirmed the microarray data. Immunolocalization of CLDNs 1, 3, 4, 8, and 10 revealed that the localization of CLDNs differed along the epididymis. In all three segments, CLDNs 1, 3, and 4 were localized to tight junctions, along the lateral margins of adjacent principal cells, and at the interface between basal and principal cells. CLDN8 was localized to tight junctions in all three segments, in addition to being localized in the caput along the lateral margins of principal cells, and in the corpus, at the interface between principal and basal cells. CLDN10, tight junction protein 1, and occludin were localized exclusively to tight junctions in all three epididymal segments. These data indicate that the epididymis displays a complex pattern of gene expression, which includes genes that are implicated in the formation of the blood-epididymal barrier, which suggests complex regulation of this barrier.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».