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Enregistrement W2125332125 · doi:10.1186/1742-6405-11-30

Greater frequency of CD5-negative CD8+ T cells against human immunodeficiency virus type 1 than other viruses is consistent with adaptation to antigenic variation

2014· article· en· W2125332125 sur OpenAlexafffund
Stephen John Penney, Maureen Gallant, Michael D. Grant

Notice bibliographique

RevueAIDS Research and Therapy · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueHIV Research and Treatment
Établissements canadiensMemorial University of Newfoundland
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchMemorial University of Newfoundland
Mots-clésAvidityCytotoxic T cellCD8T-cell receptorCD5BiologyHuman leukocyte antigenAntigenImmunologyPopulationVirologyT cellMolecular biologyImmune systemMedicineIn vitroGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: The CD5 protein antagonizes phosphorylation events downstream of T cell receptor (TCR) engagement to decrease T cell responsiveness. CD5-negative T cell clones respond preferentially over their CD5(+) counterparts against cells with low human histocompatibility-linked leukocyte antigen (HLA) levels. In human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) infection, CD5(-)CD8(+) T cells increase in prevalence with disease progression. METHODS: To investigate potential causes of this expansion of CD5(-)CD8(+) T cells in HIV-1 infection, we compared CD5 expression on CD8(+) T cells reactive against HIV-1 peptides, common viral peptides and a self peptide that together span a broad range of TCR avidities in the context of the common HLA-A2 class I restriction molecule. Following stimulation, CD5 expression on peptide-specific CD8(+) T cells was assessed by flow cytometry. RESULTS: In healthy controls, there was no significant difference in the CD5(+) percentage of CD8(+) T cells specific for common viral peptides, but a lower percentage of those responding against a common self peptide expressed CD5. The same relationship occurred in HIV-infected individuals, however, a lower percentage of HIV peptide-specific CD8(+) T cells than other viral peptide-specific CD8(+) T cells expressed CD5. In terms of overall CD5 expression level at the peptide-specific responder population level, HIV-specific CD8(+) T cells resembled those responsive against the self peptide, despite much higher avidity TCR/HLA/peptide interactions. CONCLUSIONS: This deficit in CD5 expression selective for HIV-specific CD8(+) T cells is consistent with in vivo adaptation to low avidity HIV peptide variants and has potential consequences for CD8(+) T cell expansion, cross-reactivity and autoreactivity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,069
Tête enseignante GPT0,329
Écart entre enseignants0,260 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2014
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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