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Enregistrement W2125332125 · doi:10.1186/1742-6405-11-30

Greater frequency of CD5-negative CD8+ T cells against human immunodeficiency virus type 1 than other viruses is consistent with adaptation to antigenic variation

2014· article· en· W2125332125 sur OpenAlexafffund
Stephen John Penney, Maureen Gallant, Michael D. Grant

Notice bibliographique

RevueAIDS Research and Therapy · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueHIV Research and Treatment
Établissements canadiensMemorial University of Newfoundland
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchMemorial University of Newfoundland
Mots-clésAvidityCytotoxic T cellCD8T-cell receptorCD5BiologyHuman leukocyte antigenAntigenImmunologyPopulationVirologyT cellMolecular biologyImmune systemMedicineIn vitroGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: The CD5 protein antagonizes phosphorylation events downstream of T cell receptor (TCR) engagement to decrease T cell responsiveness. CD5-negative T cell clones respond preferentially over their CD5(+) counterparts against cells with low human histocompatibility-linked leukocyte antigen (HLA) levels. In human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) infection, CD5(-)CD8(+) T cells increase in prevalence with disease progression. METHODS: To investigate potential causes of this expansion of CD5(-)CD8(+) T cells in HIV-1 infection, we compared CD5 expression on CD8(+) T cells reactive against HIV-1 peptides, common viral peptides and a self peptide that together span a broad range of TCR avidities in the context of the common HLA-A2 class I restriction molecule. Following stimulation, CD5 expression on peptide-specific CD8(+) T cells was assessed by flow cytometry. RESULTS: In healthy controls, there was no significant difference in the CD5(+) percentage of CD8(+) T cells specific for common viral peptides, but a lower percentage of those responding against a common self peptide expressed CD5. The same relationship occurred in HIV-infected individuals, however, a lower percentage of HIV peptide-specific CD8(+) T cells than other viral peptide-specific CD8(+) T cells expressed CD5. In terms of overall CD5 expression level at the peptide-specific responder population level, HIV-specific CD8(+) T cells resembled those responsive against the self peptide, despite much higher avidity TCR/HLA/peptide interactions. CONCLUSIONS: This deficit in CD5 expression selective for HIV-specific CD8(+) T cells is consistent with in vivo adaptation to low avidity HIV peptide variants and has potential consequences for CD8(+) T cell expansion, cross-reactivity and autoreactivity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,038
Score d'incertitude au seuil0,627

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,069
Tête enseignante GPT0,329
Écart entre enseignants0,260 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2014
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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