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Enregistrement W2125397071 · doi:10.1084/jem.191.9.1513

Cytoplasmic Processing Is a Prerequisite for Presentation of an Endogenous Antigen by Major Histocompatibility Complex Class II Proteins

2000· article· en· W2125397071 sur OpenAlexafffund
John D. Lich, John F. Elliott, Janice S. Blum

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Experimental Medicine · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmunotherapy and Immune Responses
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNational Institutes of HealthCanadian Diabetes Association
Mots-clésAntigen processingBiologyAntigen presentationMHC class IAntigenMajor histocompatibility complexEpitopeTransporter associated with antigen processingProteasesCell biologyEndosomeBiochemistryImmunologyT cellImmune systemEnzymeIntracellular

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Biochemical and functional studies have demonstrated major histocompatibility complex (MHC) class II-restricted presentation of select epitopes derived from cytoplasmic antigens, with few insights into the processing reactions necessary for this alternate pathway. Efficient presentation of an immunodominant epitope derived from glutamate decarboxylase (GAD) was observed regardless of whether this antigen was delivered exogenously or via a cytoplasmic route into human histocompatibility leukocyte antigen class II-DR4(+) antigen-presenting cells. Presentation of exogenous as well as cytoplasmic GAD required the intersection of GAD peptides and newly synthesized class II proteins. By contrast, proteolytic processing of this antigen was highly dependent upon the route of antigen delivery. Exogenous GAD followed the classical pathway for antigen processing, with an absolute requirement for endosomal/lysosomal acidification as well as cysteine and aspartyl proteases resident within these organelles. Presentation of endogenous GAD was dependent upon the action of cytoplasmic proteases, including the proteasome and calpain. Thus, translocation of processed antigen from the cytoplasm into membrane organelles is necessary for class II-restricted presentation via this alternate pathway. Further trimming of these peptides after translocation was mediated by acidic proteases within endosomes/lysosomes, possibly after or before class II antigen binding. These studies suggest that processing of exogenous and cytoplasmic proteins occurs through divergent but overlapping pathways. Furthermore, two cytoplasmic proteases, the proteasome and calpain, appear to play important roles in MHC class II-restricted antigen presentation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,028
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,038
Tête enseignante GPT0,315
Écart entre enseignants0,276 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations147
Publié2000
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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