Genetic Variants Associated With Myocardial Infarction Risk Factors in Over 8000 Individuals From Five Ethnic Groups
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Myocardial infarction (MI) is a leading cause of death globally, but specific genetic variants that influence MI and MI risk factors have not been assessed on a global basis. METHODS AND RESULTS: We included 8795 individuals of European, South Asian, Arab, Iranian, and Nepalese origin from the INTERHEART case-control study that genotyped 1536 single-nucleotide polymorphisms (SNPs) from 103 genes. One hundred and two SNPs were nominally associated with MI, but the statistical significance did not remain after adjustment for multiple testing. A subset of 940 SNPs from 69 genes were tested against MI risk factors. One hundred and sixty-three SNPs were nominally associated with a MI risk factor and 13 remained significant after adjusting for multiple testing. Of these 13, 11 were associated with apolipoprotein (Apo) B/A1 levels: 8 SNPs from 3 genes were associated with Apo B, and 3 cholesteryl ester transfer protein SNPs were associated with Apo A1. Seven of 8 of the SNPs associated with Apo B levels were nominally associated with MI (P<0.05), whereas none of the 3 cholesteryl ester transfer protein SNPs were associated with MI (P> or =0.17). Of the 3 SNPs most significantly associated with MI, rs7412, which defines the Apo E2 isoform, was associated with both a lower Apo B/A1 ratio (P=1.0x10(-7)) and lower MI risk (P=0.0004). Two low-density lipoprotein receptor variants, 1 intronic (rs6511720) and 1 in the 3' untranslated region (rs1433099) were both associated with a lower Apo B/A1 ratio (P<1.0x10(-5)) and a lower risk of MI (P=0.004 and P=0.003, respectively). CONCLUSIONS: Thirteen common SNPs were associated with MI risk factors. Importantly, SNPs associated with Apo B levels were associated with MI, whereas SNPs associated with Apo A1 levels were not. The Apo E isoform, and 2 common low-density lipoprotein receptor variants (rs1433099 and rs6511720) influence MI risk in this multiethnic sample.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».