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Enregistrement W2125453584 · doi:10.1099/vir.0.82314-0

In vitro integration of an ichnovirus genome segment into the genomic DNA of lepidopteran cells

2006· article· en· W2125453584 sur OpenAlexafffund
Daniel Doucet, Catherine Béliveau, Renée Lapointe, Don Stoltz, Michel Cusson

Notice bibliographique

RevueJournal of General Virology · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueInsect-Plant Interactions and Control
Établissements canadiensDalhousie UniversityNatural Resources CanadaCanadian Forest Service
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaOntario Genomics InstituteGenome Canada
Mots-clésBiologyGenomeGeneVirologyGeneticsVirus

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Polydnaviruses (PDVs) are dsDNA viruses transmitted by ichneumonid and braconid endoparasitoids to their lepidopteran hosts during oviposition. Wasp carriers are asymptomatic and transmit the virus to their progeny through the germ line; replication is confined to the calyx region of the wasp ovary, where the virus accumulates in the fluid bathing the eggs. In the lepidopteran host, however, no virus replication takes place, but PDV gene expression is essential for successful parasitism. Sustained gene expression in the absence of virus replication thus requires that the circular PDV genome segments persist for days within host cells. Available evidence suggests that most genome segments persist as episomes, but recent studies have indicated that some genome segments may undergo integration within lepidopteran genomic DNA, at least in vitro. In the present study, an integrated form of a Tranosema rostrale ichnovirus (TrIV) genome segment was cloned from genomic DNA extracted from infected Choristoneura fumiferana CF-124T cells and junction regions on either side of the viral DNA sequence were sequenced. This is the first proven example of integration of an ichnovirus genome segment in infected lepidopteran cells. Interestingly, circular forms of this genome segment do not appear to persist in these cells; none the less, a gene (TrFrep1) carried by this genome segment displays long-term transcription in infected cultured cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,062
Score d'incertitude au seuil0,354

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,209
Écart entre enseignants0,201 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations21
Publié2006
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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