<i>Vibrio parahaemolyticus</i>elevates interferon alpha production in intestinal-like epithelial Caco-2 cells
Notice bibliographique
Résumé
Vibrio parahaemolyticus is the leading cause of gastroenteritis from seafood consumption. We tried to determine how the gene expression levels of intestinal-like epithelial cells (Caco-2 cells) and mouse intestinal loop mucosal cells change upon infection with this bacterium. Since we found the robust production of interferon alpha (IFN-alpha) by the V. parahaemolyticus infection, we also assessed the upregulation of a number of IFN-stimulated genes (ISGs). The expressions of IFN protein were determined by Western blotting, and the gene expressions of Caco-2 cells after V. parahaemolyticus infection were determined by quantitative real-time reverse-transcription polymerase chain reaction. Three ISGs (i.e., IFN-alpha-inducible protein 15, IFN-alpha-inducible protein 6-16, and IFN-induced protein with tetratricopeptide repeats 1) were upregulated by V. parahaemolyticus infection. Infection induced the production of IFN-alpha, but not IFN-beta or IFN-gamma. The upregulation of the 3 ISGs was suppressed by treatment with a neutralizing IFN-alpha antibody. Moreover, the production of infection-induced IFN-alpha was found in the mouse intestinal loop mucosal cells. V. parahaemolyticus infection of Caco-2 cells results in IFN-alpha production and the expression of IFN-regulated genes.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».