Cloning and characterization of serpin-like genes from the striped rice stem borer,<i>Chilo suppressalis</i>
Notice bibliographique
Résumé
Serpins, also called serine proteinase inhibitors, are widely distributed in eukaryotes. In insects, serpins play important roles in regulating immune responses, gut physiology, and other processes. Here, we report the cloning and characterization of 12 serpin-like cDNAs from the striped rice stem borer (Chilo suppressalis), a major rice pest. The putative proteins share significant sequence similarity with known insect serpins, especially those from lepidopterons. Analysis of functional domains revealed that nine of the cloned serpins are putative trypsin- or chymotrypsin-like inhibitors; two are mixed-type serpins that may act as inhibitors for trypsins, elastases, or thrombin; and the remaining one is truncate. The potential functions of these serpins in interacting with host plants were also investigated by analyzing tissue-specific expression and the impact of different host plant genotypes on gene expression. Our results provide a foundation for future studies on the role of serpins in gut physiology in the striped rice stem borer, and also useful information for comparative analyses of serpins from different insect species.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».