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Enregistrement W2125633042 · doi:10.1128/iai.68.7.4217-4224.2000

The Most Abundant Glycoprotein of Amebic Cyst Walls (Jacob) Is a Lectin with Five Cys-Rich, Chitin-Binding Domains

2000· article· en· W2125633042 sur OpenAlexfundno aff
Marta Frisardi, Sudip Kumar Ghosh, Jessica Field, Katrina Van Dellen, Rick A. Rogers, Phillips W. Robbins, John Samuelson

Notice bibliographique

RevueInfection and Immunity · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAmoebic Infections and Treatments
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNational Institute of General Medical SciencesNational Heart, Lung, and Blood InstituteYork UniversityNational Institutes of HealthHarvard University
Mots-clésChitinLectinBiologyConcanavalin AGlycoproteinBiochemistryMucinEntamoeba histolyticaMicrobiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The infectious stage of amebae is the chitin-walled cyst, which is resistant to stomach acids. In this study an extraordinarily abundant, encystation-specific glycoprotein (Jacob) was identified on two-dimensional protein gels of cyst walls purified from Entamoeba invadens. Jacob, which was acidic and had an apparent molecular mass of approximately 100 kDa, contained sugars that bound to concanavalin A and ricin. The jacob gene encoded a 45-kDa protein with a ladder-like series of five Cys-rich domains. These Cys-rich domains were reminiscent of but not homologous to the Cys-rich chitin-binding domains of insect chitinases and peritrophic matrix proteins that surround the food bolus in the insect gut. Jacob bound purified chitin and chitin remaining in sodium dodecyl sulfate-treated cyst walls. Conversely, the E. histolytica plasma membrane Gal/GalNAc lectin bound sugars of intact cyst walls and purified Jacob. In the presence of galactose, E. invadens formed wall-less cysts, which were quadranucleate and contained Jacob and chitinase (another encystation-specific protein) in secretory vesicles. A galactose lectin was found to be present on the surface of wall-less cysts, which phagocytosed bacteria and mucin-coated beads. These results suggest that the E. invadens cyst wall forms when the plasma membrane galactose lectin binds sugars on Jacob, which in turn binds chitin via its five chitin-binding domains.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,463
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,246
Écart entre enseignants0,238 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations80
Publié2000
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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