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Enregistrement W2125649379 · doi:10.1128/jvi.78.1.454-463.2004

The Adenovirus E3-6.7K Protein Adopts Diverse Membrane Topologies following Posttranslational Translocation

2003· article· en· W2125649379 sur OpenAlexafffund
Alexander R. Moise, Jason R. Grant, Roger Lippé, Reinhard Gabathuler, Wilfred A. Jefferies

Notice bibliographique

RevueJournal of Virology · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueVirus-based gene therapy research
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésBiologyCytoplasmCell biologyRibosomeEndoplasmic reticulumTransfectionChromosomal translocationHEK 293 cellsTranslation (biology)Molecular biologyGeneRNAMessenger RNABiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The E3 region of adenovirus codes for several membrane proteins, most of which are involved in immune evasion and prevention of host cell apoptosis. We explored the topology and targeting mechanisms of E3-6.7K, the most recently described member of this group, by using an in vitro translation system supplemented with microsomes. Here, we present evidence that E3-6.7K, one of the smallest signal-anchor proteins known, translocates across the membrane of the endoplasmic reticulum in a posttranslational, ribosome-independent, yet ATP-dependent manner, reminiscent of the translocation of tail-anchored proteins. Our analysis also demonstrated that E3-6.7K could achieve several distinct topological fates. In addition to the previously postulated type III orientation (N-luminal/C-cytoplasmic, termed NtmE3-6.7K), we detected a tail-anchored form adopting the opposite orientation (N-cytoplasmic/C-luminal, termed CtmE3-6.7K) as well as the possibility of a fully translocated form (N and C termini are both translocated, termed NCE3-6.7K). Due to the translocation of a positively charged domain, both the CtmE3-6.7K and NCE3-6.7K topologies of E3-6.7K constitute exceptions to the "positive inside" rule. The NtmE3-6.7K and NCE3-6.7K are the first examples of posttranslationally translocated proteins in higher eukaryotes that are not tail anchored. Distinct topological forms were also found in transfected cells, as both N and C termini of E3-6.7K were detected on the extracellular surface of transfected cells. The demonstration of unexpected topological forms and translocation mechanisms for E3-6.7K defies conventional thinking about membrane protein topogenesis and advises that both the mode of targeting and topology of signal-anchor proteins should be determined experimentally.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,018
Score d'incertitude au seuil0,365

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,304
Écart entre enseignants0,281 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations19
Publié2003
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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