MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2125701719 · doi:10.1128/aem.01052-10

Correlation of Particular Bacterial PCR-Denaturing Gradient Gel Electrophoresis Patterns with Bovine Ruminal Fermentation Parameters and Feed Efficiency Traits

2010· article· en· W2125701719 sur OpenAlexaff
Emma Hernandez‐Sanabria, Le Luo Guan, Laksiri A. Goonewardene, Meiju Li, Denis F. Mujibi, Paul Stothard, S. S. Moore, Monica C. Leon-Quintero

Notice bibliographique

RevueApplied and Environmental Microbiology · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueRuminant Nutrition and Digestive Physiology
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTemperature gradient gel electrophoresisRumenBiologyFeed conversion ratioResidual feed intakeIsovalerateFermentationDry matterFood scienceBacteriaAnimal science16S ribosomal RNAButyrateGeneticsBody weight

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The influence of rumen microbial structure and functions on host physiology remains poorly understood. This study aimed to investigate the interaction between the ruminal microflora and the host by correlating bacterial diversity with fermentation measurements and feed efficiency traits, including dry matter intake, feed conversion ratio, average daily gain, and residual feed intake, using culture-independent methods. Universal bacterial partial 16S rRNA gene products were amplified from ruminal fluid collected from 58 steers raised under a low-energy diet and were subjected to PCR-denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE) analysis. Multivariate statistical analysis was used to relate specific PCR-DGGE bands to various feed efficiency traits and metabolites. Analysis of volatile fatty acid profiles showed that butyrate was positively correlated with daily dry matter intake (P < 0.05) and tended to have higher concentration in inefficient animals (P = 0.10), while isovalerate was associated with residual feed intake (P < 0.05). Our results suggest that particular bacteria and their metabolism in the rumen may contribute to differences in host feed efficiency under a low-energy diet. This is the first study correlating PCR-DGGE bands representing specific bacteria to metabolites in the bovine rumen and to host feed efficiency traits.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,773
Score d'incertitude au seuil0,235

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,159
Écart entre enseignants0,155 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations118
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueApplied and Environmental MicrobiologyMême sujetRuminant Nutrition and Digestive PhysiologyTravaux en français237 207