Distinct bacterial colonization patterns of Escherichia coli subtypes associate with rheumatoid factor status in early inflammatory arthritis
Notice bibliographique
Résumé
OBJECTIVES: The aetiology of RA is unknown; however, bacterial exposure, particularly to Escherichia coli, Proteus mirabilis and Klebsiella pneumoniae, has been linked to disease pathogenesis. The strongest association was observed for RF(+) RA. We compare colonization patterns of these bacteria, and the anti-bacterial antibody levels in early onset RF(+) and RF(-) inflammatory arthritis. METHODS: Bacteria isolated from stool and urine of early-stage RF(+) and RF(-) patients recruited to the Early Arthritis Registry were biochemically identified and genotyped. IgM and IgA anti-bacterial and RF antibodies were assessed by ELISA. RESULTS: Differences in the types of colonizing pathogenic E. coli were identified. RF(+) patients were more commonly colonized with phylogenetic Group D E. coli, whereas RF(-) patients were more commonly colonized with phylogenetic Group B2 E. coli and these individuals also had lower joint scores and inflammatory markers yet higher IgA anti-E. coli antibody responses. CONCLUSIONS: These studies link the type of colonizing bacteria in the gut and urine with the immune response (anti-bacterial and RF) in early-onset inflammatory arthritis and provide evidence for a role of the host-pathogen response in the aetiology of RF.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».