NOXA and PUMA Expression Add to Clinical Markers in Predicting Biochemical Recurrence of Prostate Cancer Patients in a Survival Tree Model
Notice bibliographique
Résumé
PURPOSE: To assess the expression of proapoptotic NOXA and PUMA in prostate tissues and delineate their association with prostate cancer (PCa) recurrence. EXPERIMENTAL DESIGN: Normal, prostatic intraepithelial neoplasia (PIN), hormone-sensitive (HS) PCa, and hormone-refractory (HR) PCa tissues were used to build tissue microarrays encompassing a total of 135 patients. Two observers assessed the intensity of NOXA and PUMA immunohistochemical staining using a composite color scale. One hundred and eighty recursive partitioning and regression tree (RPART) models were generated to predict biochemical recurrence (BCR) within HS cancer patients using NOXA, PUMA, and clinical parameters. Models were then ranked according to the integrated Brier score (IBS). RESULTS: Increasing NOXA expression was associated with PCa progression, reaching the highest levels in HR PCa. Increased NOXA expression was observed in 68% of HS cancer patients and was predictive of BCR (LR = 8.64; P = 0.003). In contrast, PUMA expression was highest in HS cancer, and although 70% of HS cancer patients exhibited increased PUMA expression, PUMA alone could not predict the onset of BCR. Interestingly, the top-ranking RPART model generated [IBS = 0.107; 95% confidence interval (95% CI), 0.065-0.128] included surgical margin status and NOXA and PUMA expression, although recurrent prognostic classification schemes obtained in the top 10 models favored a survival tree model containing margin status, NOXA expression, and preoperative prostate-specific antigen (PSA) (IBS = 0.114; 95% CI, 0.069-0.142). CONCLUSION: We conclude that NOXA and PUMA expression may be linked to PCa progression and propose further validation of a survival tree model including surgical margin status, NOXA expression, and preoperative PSA for predicting BCR.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,003 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».