MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2125823125 · doi:10.1128/mcb.20.11.4036-4048.2000

Aberrant Splicing of tau Pre-mRNA Caused by Intronic Mutations Associated with the Inherited Dementia Frontotemporal Dementia with Parkinsonism Linked to Chromosome 17

2000· article· en· W2125823125 sur OpenAlexfundno aff
Zhi‐Hong Jiang, Jocelyn Côté, Jennifer M. Kwon, Alison Goate, Jane Y. Wu

Notice bibliographique

RevueMolecular and Cellular Biology · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA Research and Splicing
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of General Medical SciencesNational Institutes of HealthNational Cancer InstituteNational Eye InstituteNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaNational Institute on Aging
Mots-clésRNA splicingBiologysnRNPMinigeneExonGeneticsIntronFrontotemporal dementiaAlternative splicingGeneDementiaRNAMedicinePathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Frontotemporal dementia accounts for a significant fraction of dementia cases. Frontotemporal dementia with parkinsonism linked to chromosome 17 is associated with either exonic or intronic mutations in the tau gene. This highlights the involvement of aberrant pre-mRNA splicing in the pathogenesis of neurodegenerative disorders. Little is known about the molecular mechanisms of the splicing defects underlying these diseases. To establish a model system for studying the role of pre-mRNA splicing in neurodegenerative diseases, we have constructed a tau minigene that reproduces tau alternative splicing in both cultured cells and in vitro biochemical assays. We demonstrate that mutations in a nonconserved intronic region of the human tau gene lead to increased splicing between exon 10 and exon 11. Systematic biochemical analyses indicate the importance of U1 snRNP and, to a lesser extent, U6 snRNP in differentially recognizing wild-type versus intron mutant tau pre-mRNAs. Gel mobility shift assays with purified U1 snRNP and oligonucleotide-directed RNase H cleavage experiments support the idea that the intronic mutations destabilize a stem-loop structure that sequesters the 5' splice site downstream of exon 10 in tau pre-mRNA, leading to increases in U1 snRNP binding and in splicing between exon 10 and exon 11. Thus, mutations in nonconserved intronic regions that increase rather than decrease alternative splicing can be an important pathogenic mechanism for the development of human diseases.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,049
Score d'incertitude au seuil0,681

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,226
Écart entre enseignants0,220 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations135
Publié2000
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueMolecular and Cellular BiologyMême sujetRNA Research and SplicingTravaux en français237 207